106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1390 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  88.38 
 
 		 251 aa  455  1e-127  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  87.88 
 
 		 243 aa  433  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  86.08 
 
 		 242 aa  423  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  54.7 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  52.3 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  52.72 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  50.83 
 
 		 259 aa  241  7e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  50.42 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  50.42 
 
 		 259 aa  238  4e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  50.42 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  48.51 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  48.32 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  46.58 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  53.14 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  46.64 
 
 		 240 aa  221  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  44.58 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  45.57 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  46.64 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  46.98 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  46.53 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  46.12 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  50.99 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  48.05 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  45.06 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  46.49 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  46.72 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  48.83 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  45.92 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  46.64 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  48.69 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  46.15 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  44.35 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  49.16 
 
 		 245 aa  182  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  43.69 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  42.86 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  41.74 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  39.48 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  40 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  38.6 
 
 		 285 aa  171  7.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  43.54 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  39.76 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  40.83 
 
 		 257 aa  167  9e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  42.62 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  48.7 
 
 		 233 aa  164  8e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  37.71 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  38.57 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  36.82 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  42.55 
 
 		 280 aa  150  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  46.52 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  35.71 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  36.41 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  37.5 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  35.25 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  32.85 
 
 		 278 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  37.2 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  36.04 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  35.84 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  41.62 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  33.82 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  39.22 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  41.67 
 
 		 269 aa  128  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  41.67 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  34.33 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  35.04 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  35.68 
 
 		 298 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  29.82 
 
 		 245 aa  102  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  35.23 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  32.62 
 
 		 236 aa  95.9  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  33.15 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  30.5 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  26.92 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  28.64 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  28.89 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  31 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  30.34 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  29.41 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  28.44 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  28.44 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  30.68 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  32.47 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  27.18 
 
 		 210 aa  72  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  27.86 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  30.11 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  28.09 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  30.59 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  29.23 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  31.18 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  27.94 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  32.35 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  25.43 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  27.98 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.12 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.28 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  25.84 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  28.07 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  26.59 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>