174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1573 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 
219 aa  441  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  88.58 
 
 
219 aa  401  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  88.58 
 
 
219 aa  401  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  87.67 
 
 
219 aa  397  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  74.88 
 
 
217 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  50 
 
 
211 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  49.51 
 
 
207 aa  216  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  53.16 
 
 
210 aa  210  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  47.34 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  50.49 
 
 
209 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  48.33 
 
 
213 aa  193  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  50.79 
 
 
214 aa  188  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  47.15 
 
 
212 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  46.73 
 
 
200 aa  166  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  39.29 
 
 
210 aa  158  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  42.33 
 
 
217 aa  151  8e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.18 
 
 
225 aa  148  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  41.38 
 
 
243 aa  148  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  41.12 
 
 
210 aa  148  8e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  40.22 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  39.89 
 
 
202 aa  135  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  40 
 
 
200 aa  134  8e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  40.44 
 
 
201 aa  132  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.38 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  34.69 
 
 
198 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  38.17 
 
 
204 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  36.65 
 
 
203 aa  126  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  38.38 
 
 
234 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  37.17 
 
 
243 aa  124  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  37.08 
 
 
206 aa  121  8e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  37.17 
 
 
237 aa  121  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.84 
 
 
243 aa  121  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  33.16 
 
 
203 aa  118  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  32.98 
 
 
203 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  33.51 
 
 
203 aa  116  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  35.15 
 
 
250 aa  115  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  33.87 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  31.82 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  36.76 
 
 
237 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  35.24 
 
 
282 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  26.21 
 
 
282 aa  106  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  35.36 
 
 
200 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  32.58 
 
 
283 aa  105  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  31.22 
 
 
279 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  33.18 
 
 
259 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  34.84 
 
 
259 aa  101  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  34.84 
 
 
259 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  31.8 
 
 
288 aa  99.8  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  27.27 
 
 
296 aa  99.4  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  29.39 
 
 
290 aa  99  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  34.84 
 
 
259 aa  99  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  28.16 
 
 
301 aa  97.8  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  29.6 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  31.84 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  31.38 
 
 
197 aa  97.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  32.43 
 
 
292 aa  94.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  28.51 
 
 
284 aa  93.2  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  36.31 
 
 
270 aa  92.8  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  32.11 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  29.63 
 
 
282 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  33.71 
 
 
283 aa  92.4  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  34.62 
 
 
251 aa  92  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  33.71 
 
 
276 aa  92  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  32.89 
 
 
306 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  35.26 
 
 
302 aa  91.3  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  35.62 
 
 
271 aa  90.9  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  29.03 
 
 
285 aa  90.5  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  34.62 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  29.36 
 
 
273 aa  89.4  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  30.49 
 
 
249 aa  89.4  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  32.2 
 
 
280 aa  89.4  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  31.39 
 
 
304 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  31.39 
 
 
304 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  31.39 
 
 
304 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  31.38 
 
 
288 aa  88.6  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  33.33 
 
 
280 aa  88.6  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  31.82 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  29.63 
 
 
278 aa  87.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  29.56 
 
 
272 aa  86.3  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  29.33 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  30.94 
 
 
324 aa  84.7  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  30.99 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  28.44 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  30.56 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  36.31 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  33.33 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  27.37 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  32.7 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.137735 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  30.32 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  33.33 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  39.42 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  32.42 
 
 
263 aa  82  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  32.79 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  26.89 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  29.96 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  28.96 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  32.43 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  29.15 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  30.1 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  27.06 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>