103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4461 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  65.31 
 
 
324 aa  360  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  65.68 
 
 
279 aa  354  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  60.37 
 
 
283 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  58.06 
 
 
290 aa  322  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  61.72 
 
 
276 aa  317  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  55.63 
 
 
284 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  58.67 
 
 
304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  57.56 
 
 
274 aa  311  6.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  63.14 
 
 
288 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  57.61 
 
 
288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2682  20S proteasome A and B subunits  61.39 
 
 
280 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  56.99 
 
 
302 aa  305  6e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  54.98 
 
 
280 aa  305  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  56.79 
 
 
282 aa  303  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  58.4 
 
 
285 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  55.35 
 
 
282 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22030  proteasome endopeptidase complex, beta component  56.36 
 
 
289 aa  295  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00409578  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  58.91 
 
 
273 aa  293  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  54.41 
 
 
282 aa  291  8e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  57.74 
 
 
278 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  61.23 
 
 
306 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  57.41 
 
 
270 aa  281  9e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  57.03 
 
 
304 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  57.03 
 
 
304 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  57.03 
 
 
304 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  56.76 
 
 
275 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  53.38 
 
 
303 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  53.82 
 
 
292 aa  271  9e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  52.49 
 
 
273 aa  262  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  55.81 
 
 
272 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12142  proteasome beta subunit prcB  56.98 
 
 
291 aa  256  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000259602  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  52 
 
 
280 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1015  20S proteasome, A and B subunits  51.78 
 
 
282 aa  248  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.410005  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  56.05 
 
 
273 aa  243  3e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  47.1 
 
 
302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  31.22 
 
 
219 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  31.22 
 
 
219 aa  102  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  30.77 
 
 
219 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  30.77 
 
 
219 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  30.23 
 
 
217 aa  100  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  30.85 
 
 
211 aa  95.9  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  31.55 
 
 
210 aa  91.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  31.16 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  28.96 
 
 
207 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  31.69 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  32.42 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  31.79 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  29.51 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  30.23 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  32.26 
 
 
197 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  25.59 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  31.69 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  26.54 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  28.02 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.32 
 
 
196 aa  65.1  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  30.29 
 
 
234 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.32 
 
 
243 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.37 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  27.75 
 
 
217 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.84 
 
 
243 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  30.22 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  27.08 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  26.88 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  29.67 
 
 
259 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  27.57 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  29.67 
 
 
259 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  26.23 
 
 
187 aa  55.8  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  24.73 
 
 
196 aa  55.5  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  26.29 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  29.44 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  28.11 
 
 
204 aa  53.9  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  28.74 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.67 
 
 
203 aa  53.1  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.28 
 
 
210 aa  52.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  25.64 
 
 
203 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  24.62 
 
 
203 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  27.94 
 
 
200 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  25.37 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  25.26 
 
 
203 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  28.29 
 
 
201 aa  50.8  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  26.37 
 
 
267 aa  49.7  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  26.19 
 
 
201 aa  48.9  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  26.78 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  27.42 
 
 
240 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  24.6 
 
 
200 aa  46.2  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  23.35 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  26.78 
 
 
198 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  25.39 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  22.63 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  27.96 
 
 
202 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  26.58 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02950  endopeptidase, putative  33.33 
 
 
280 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0631891  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0131  ATP-dependent protease peptidase subunit  30.56 
 
 
178 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0440313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0167  ATP-dependent protease peptidase subunit  30.56 
 
 
178 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  34.57 
 
 
187 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  29.1 
 
 
263 aa  43.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.93 
 
 
181 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.93 
 
 
181 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  37.88 
 
 
179 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>