98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3077 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  100 
 
 		 303 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  84.31 
 
 		 306 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  81.79 
 
 		 304 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  81.79 
 
 		 304 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  81.79 
 
 		 304 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12142  proteasome beta subunit prcB  71.72 
 
 		 291 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000259602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  59.77 
 
 		 292 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  59.68 
 
 		 282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22030  proteasome endopeptidase complex, beta component  56.07 
 
 		 289 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00409578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  57.42 
 
 		 304 aa  281  7.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  53.38 
 
 		 279 aa  276  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  56.49 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  53.57 
 
 		 280 aa  275  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  49.66 
 
 		 284 aa  267  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  52.16 
 
 		 274 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1015  20S proteasome, A and B subunits  55.91 
 
 		 282 aa  266  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.410005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2682  20S proteasome A and B subunits  55.17 
 
 		 280 aa  265  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479175  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  53.52 
 
 		 290 aa  263  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  54.05 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  53.54 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  52.55 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  54.72 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  50.55 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  49.29 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  49.46 
 
 		 302 aa  255  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  55.74 
 
 		 288 aa  252  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  52.31 
 
 		 276 aa  251  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  50.55 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  49.61 
 
 		 273 aa  249  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  54.51 
 
 		 270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  50.75 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  49.43 
 
 		 275 aa  232  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  52.73 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  44.78 
 
 		 302 aa  211  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  45.38 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  46.52 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  31.08 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  31.08 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  32.7 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  34.22 
 
 		 212 aa  82  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  33.86 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  30.73 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  34.12 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  31.75 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  31.6 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  31.22 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  33.65 
 
 		 214 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  31.36 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  34.16 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  27.56 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  29.27 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  31 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  29.19 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  31.44 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  30.1 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  30.41 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  26.2 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  29.91 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  27.46 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  29.03 
 
 		 187 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  27.93 
 
 		 201 aa  52.8  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.75 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  27.04 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.48 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  24.73 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  29.23 
 
 		 197 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.81 
 
 		 196 aa  50.1  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  26.46 
 
 		 203 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2740  ATP-dependent protease peptidase subunit  32.09 
 
 		 176 aa  49.3  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  34.07 
 
 		 179 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  28.87 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2743  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.027764  normal  0.613986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.34 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  28.96 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  26.87 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  30.07 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.23 
 
 		 210 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  25.24 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  33.82 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  26.73 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  38.03 
 
 		 181 aa  46.2  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  26.54 
 
 		 203 aa  46.2  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 		 201 aa  45.8  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  27.06 
 
 		 250 aa  45.8  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.46 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  27.98 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  28.32 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  25.53 
 
 		 202 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  25.35 
 
 		 200 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  26.6 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  32.67 
 
 		 187 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  26.92 
 
 		 184 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  34.78 
 
 		 271 aa  43.1  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  37.68 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  26.67 
 
 		 184 aa  42.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  27.6 
 
 		 250 aa  42.4  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  37.68 
 
 		 259 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  24.78 
 
 		 225 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>