161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2272 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  100 
 
 
237 aa  477  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  77.54 
 
 
243 aa  346  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  77.54 
 
 
243 aa  341  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  65.96 
 
 
234 aa  288  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  76.02 
 
 
237 aa  286  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  56.09 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  47.67 
 
 
250 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  41.4 
 
 
214 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  41.5 
 
 
200 aa  144  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  40.7 
 
 
210 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  40.32 
 
 
207 aa  141  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  38.71 
 
 
211 aa  138  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  40.1 
 
 
212 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  42.49 
 
 
209 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  39.27 
 
 
217 aa  137  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  39.41 
 
 
219 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  39.41 
 
 
219 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  38 
 
 
219 aa  132  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  38.42 
 
 
219 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  39.67 
 
 
211 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  39.46 
 
 
213 aa  129  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  37.3 
 
 
210 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.51 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  35.83 
 
 
196 aa  115  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  37.14 
 
 
204 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  37.97 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.02 
 
 
225 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  36.17 
 
 
203 aa  106  3e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  36.96 
 
 
201 aa  105  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  37.5 
 
 
201 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  36.41 
 
 
202 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  33.51 
 
 
203 aa  101  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  32.98 
 
 
203 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  31.08 
 
 
283 aa  99.4  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  31.55 
 
 
203 aa  99  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  34.41 
 
 
217 aa  99  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  30.93 
 
 
282 aa  95.1  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  31.52 
 
 
200 aa  93.2  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  29.26 
 
 
301 aa  91.7  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  32.43 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  30.81 
 
 
196 aa  89  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  34.27 
 
 
206 aa  89  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  30.32 
 
 
198 aa  87.8  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  27.83 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  29.51 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  31.46 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  29.65 
 
 
201 aa  79  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  31.18 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  25.81 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  28.18 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  27.92 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  28.73 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  29.35 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  27.83 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  29.26 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  28.21 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  29.59 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  30.26 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  28.98 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  28.71 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  29.47 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  27.59 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  28.09 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  28.41 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  29.73 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  28.41 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  25.41 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  29.58 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  26.78 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  29.53 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.04 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  28.99 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  28.16 
 
 
238 aa  67  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  26.63 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  28.49 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  27.13 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  27.6 
 
 
272 aa  64.3  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  23.56 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  28.78 
 
 
278 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  25.95 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  28.42 
 
 
197 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  28.49 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  29.21 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  25.4 
 
 
239 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  29.59 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  29.27 
 
 
280 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  27.59 
 
 
276 aa  62.4  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  28.57 
 
 
279 aa  62.4  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  29.65 
 
 
204 aa  62  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  26.63 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  28.35 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  27.7 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  28.09 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  26.26 
 
 
274 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02950  endopeptidase, putative  29.67 
 
 
280 aa  60.1  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0631891  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  28.89 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  25.14 
 
 
290 aa  59.7  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  26.7 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  25.7 
 
 
304 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  25.67 
 
 
283 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>