96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC03530 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  100 
 
 
303 aa  624  1e-178  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  63.91 
 
 
272 aa  347  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  60 
 
 
267 aa  318  7e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  63.46 
 
 
201 aa  256  5e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  44.72 
 
 
199 aa  149  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  35.35 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  32.99 
 
 
211 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  33.33 
 
 
200 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  35.05 
 
 
209 aa  109  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  34 
 
 
213 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  34.36 
 
 
214 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  29.65 
 
 
210 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  30.61 
 
 
243 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  31.94 
 
 
211 aa  95.9  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  32.11 
 
 
201 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  29.19 
 
 
225 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  32.21 
 
 
210 aa  93.6  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  27.72 
 
 
233 aa  93.2  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  29.31 
 
 
204 aa  92.8  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  33.85 
 
 
217 aa  92.8  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  30.93 
 
 
198 aa  92  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  30.68 
 
 
200 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  30.89 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  31.21 
 
 
201 aa  89.7  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.59 
 
 
225 aa  89.4  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.75 
 
 
196 aa  87.8  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  28.74 
 
 
200 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  27.95 
 
 
283 aa  87  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.9 
 
 
210 aa  86.3  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  31.05 
 
 
202 aa  85.9  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  30.86 
 
 
206 aa  84  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  29.2 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  30.26 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  27.18 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  26.83 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  24.32 
 
 
213 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  29.52 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  28.02 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  28.57 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  26.96 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.98 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.65 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  27.22 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  28.16 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  26.01 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  27.04 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  27.04 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  27.04 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.09 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  24.72 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  27.53 
 
 
234 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  25.29 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  25.5 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  27.84 
 
 
197 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  23.83 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  26.53 
 
 
247 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  26 
 
 
259 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  25.81 
 
 
250 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  26.14 
 
 
243 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  26 
 
 
259 aa  57  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04990  proteasome subunit beta type 2, putative  26.55 
 
 
224 aa  56.6  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.846923  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  24.39 
 
 
246 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31764  predicted protein  23.68 
 
 
289 aa  56.6  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0071372 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  24.68 
 
 
248 aa  56.6  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  25.71 
 
 
237 aa  56.2  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  22.97 
 
 
270 aa  55.8  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  27.45 
 
 
259 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  22.28 
 
 
227 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  26.47 
 
 
259 aa  53.1  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  24.62 
 
 
249 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  23.3 
 
 
237 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  26.67 
 
 
240 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  26.29 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  24.02 
 
 
251 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  25.74 
 
 
267 aa  49.7  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  26.46 
 
 
274 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  24.87 
 
 
187 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  25.35 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  22.22 
 
 
245 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  23.53 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  29.69 
 
 
278 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  26.16 
 
 
249 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  23.72 
 
 
256 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  24.39 
 
 
250 aa  45.8  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  27.01 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  24.75 
 
 
263 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04457  20S proteasome beta-type subunit (Eurofung)  22.73 
 
 
203 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0477671  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  25 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  24.28 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  23.27 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  21.02 
 
 
268 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  24.55 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  26.23 
 
 
290 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  24.04 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  22.71 
 
 
257 aa  43.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  25.35 
 
 
288 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>