129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_5311 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  100 
 
 		 201 aa  417  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  61.69 
 
 		 272 aa  253  9e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  63.46 
 
 		 303 aa  251  7e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  53.73 
 
 		 267 aa  222  3e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  46.46 
 
 		 199 aa  152  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  35.39 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  31.52 
 
 		 233 aa  104  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  35.33 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  31.41 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  35.48 
 
 		 213 aa  99  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  32.24 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  30.98 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  34.59 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  31.89 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  27.68 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  31.55 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  32.98 
 
 		 232 aa  89.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  30.16 
 
 		 198 aa  89.7  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  30.89 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  33.33 
 
 		 209 aa  88.2  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  32.99 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  31.94 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  30.41 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  32.81 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  30 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  28.98 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.16 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  31.11 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  28.26 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  28.06 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  27.72 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  28.26 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  27.98 
 
 		 297 aa  78.6  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  26.13 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  30.27 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  30.43 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  25.77 
 
 		 282 aa  75.1  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  26.88 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  32.57 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  26.24 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  27.55 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  27.55 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.74 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  27.41 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  27.64 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  25.46 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  27.04 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.9 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.57 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  28.93 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.65 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.42 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04990  proteasome subunit beta type 2, putative  25.62 
 
 		 224 aa  62  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.846923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  23.98 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  27.33 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  28.17 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  27.75 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  28.66 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  25.26 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  28.33 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  30.65 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  27.06 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  28.12 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  25.76 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  27.5 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  27.91 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  24.24 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  24.46 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  30.6 
 
 		 285 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  27.06 
 
 		 263 aa  53.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  21.21 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  22.45 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  25.68 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  27.93 
 
 		 303 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  26.74 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  24.87 
 
 		 249 aa  52  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  28.02 
 
 		 302 aa  51.2  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  25.42 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  25.97 
 
 		 282 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  27.06 
 
 		 302 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  31.21 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  23.57 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  27.27 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  27.75 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  27.32 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  27.32 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  27.32 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  27.04 
 
 		 324 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  27.38 
 
 		 284 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  26.86 
 
 		 268 aa  48.9  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2682  20S proteasome A and B subunits  24.31 
 
 		 280 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  29.07 
 
 		 276 aa  48.5  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  24.35 
 
 		 247 aa  48.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  28.04 
 
 		 306 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  26.59 
 
 		 292 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  27.17 
 
 		 283 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  24 
 
 		 240 aa  48.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  27.06 
 
 		 280 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  26.71 
 
 		 280 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  24.75 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>