114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1204 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 		 302 aa  614  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  58.36 
 
 		 285 aa  318  9e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  60.82 
 
 		 276 aa  316  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  56.27 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  55.39 
 
 		 288 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  57.14 
 
 		 270 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  55.91 
 
 		 273 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  55.38 
 
 		 290 aa  287  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  53.05 
 
 		 284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  52.16 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  50 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  49.44 
 
 		 282 aa  269  5e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  51.89 
 
 		 282 aa  269  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  54.3 
 
 		 275 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  54.2 
 
 		 288 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2682  20S proteasome A and B subunits  53.36 
 
 		 280 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  49.64 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  55.88 
 
 		 272 aa  262  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  47.1 
 
 		 279 aa  262  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  48.88 
 
 		 274 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  48.47 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  49.62 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  50 
 
 		 279 aa  258  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22030  proteasome endopeptidase complex, beta component  47.43 
 
 		 289 aa  252  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00409578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  47.39 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  49.24 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  50.83 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  51.52 
 
 		 278 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  47.53 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  44.78 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1015  20S proteasome, A and B subunits  43.64 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.410005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  44.92 
 
 		 304 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  44.92 
 
 		 304 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  44.92 
 
 		 304 aa  225  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  45.14 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12142  proteasome beta subunit prcB  44.79 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000259602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  32.86 
 
 		 217 aa  99.8  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  31.84 
 
 		 219 aa  94.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  31.31 
 
 		 212 aa  92  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  34.08 
 
 		 219 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  34.08 
 
 		 219 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  31.75 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  30.16 
 
 		 207 aa  87.4  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  29 
 
 		 211 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  30 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  28.09 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  28.65 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  28.37 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  26.48 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  28.11 
 
 		 209 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  26.4 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.32 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  31.79 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  27.13 
 
 		 217 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29 
 
 		 196 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.06 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  28.65 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  26.92 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  31.74 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  26.54 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  27.22 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.19 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  30.94 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  25.85 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.26 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  22.91 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  24.64 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  26.95 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  27.59 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  23.66 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  25.41 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  27.47 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  23.66 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  25 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  28.39 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  26.29 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  26.29 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  26.29 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  24.19 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  28.73 
 
 		 206 aa  53.1  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  25.82 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  24.86 
 
 		 196 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  27.06 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  26.35 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  28.38 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  25.87 
 
 		 203 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  22.38 
 
 		 217 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  30.18 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  27.62 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  23.68 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31764  predicted protein  23.12 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0071372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  29.32 
 
 		 185 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  24.86 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  26.09 
 
 		 203 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  21.67 
 
 		 199 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  25.28 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 		 203 aa  45.8  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  25.67 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  29.17 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303381 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>