106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2627 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  100 
 
 		 304 aa  610  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  86.03 
 
 		 274 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  61.82 
 
 		 290 aa  338  7e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  62.36 
 
 		 284 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  61.65 
 
 		 283 aa  335  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  57.09 
 
 		 302 aa  331  8e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  60.52 
 
 		 288 aa  331  8e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  60.63 
 
 		 324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  62.4 
 
 		 276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  59.7 
 
 		 285 aa  319  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  61.4 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  58.67 
 
 		 279 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  57.84 
 
 		 280 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  55.19 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  55.22 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  56.62 
 
 		 282 aa  298  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  59 
 
 		 270 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  57.25 
 
 		 273 aa  296  4e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  57.25 
 
 		 278 aa  289  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2682  20S proteasome A and B subunits  59.71 
 
 		 280 aa  288  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  55.72 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  55.84 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  57.2 
 
 		 275 aa  281  7.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  57.42 
 
 		 303 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  57.31 
 
 		 272 aa  281  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22030  proteasome endopeptidase complex, beta component  53.55 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00409578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  53.94 
 
 		 304 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  53.94 
 
 		 304 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  53.94 
 
 		 304 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  53.76 
 
 		 280 aa  269  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  53.12 
 
 		 273 aa  265  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1015  20S proteasome, A and B subunits  53.51 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.410005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  53.91 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  50.41 
 
 		 273 aa  247  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12142  proteasome beta subunit prcB  52.92 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000259602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  48.47 
 
 		 302 aa  242  7e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  31.39 
 
 		 219 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  31.39 
 
 		 219 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  30.49 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  29.6 
 
 		 219 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  31.92 
 
 		 214 aa  97.1  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  29.58 
 
 		 211 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  30.63 
 
 		 211 aa  93.6  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  27.91 
 
 		 217 aa  93.2  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  31.14 
 
 		 213 aa  90.5  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  30.63 
 
 		 207 aa  89  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  30.05 
 
 		 210 aa  86.7  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  29.58 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  32.54 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  32.54 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  30.88 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  30.05 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  30.48 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  31.92 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  27.01 
 
 		 200 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  27.54 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.46 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  27.93 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  27.19 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  27 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  27.5 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  30.73 
 
 		 267 aa  67  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  26.5 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.17 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  26.83 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  25.69 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  26.73 
 
 		 199 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  28.17 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  28.18 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.79 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  26.5 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  29.47 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  29.38 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.87 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  27.75 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  29.59 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  26.34 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.37 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.6 
 
 		 237 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  26.34 
 
 		 250 aa  52.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  25.35 
 
 		 198 aa  52.8  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  27.66 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  26.22 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  25.13 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  23.44 
 
 		 246 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2740  ATP-dependent protease peptidase subunit  29.47 
 
 		 176 aa  49.3  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  26.05 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  24.31 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  22.22 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  26.29 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  25.45 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  28.51 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  26.15 
 
 		 272 aa  46.6  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  28.79 
 
 		 242 aa  46.2  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  22.17 
 
 		 250 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.27 
 
 		 181 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  25.27 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 		 203 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  24.19 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>