157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3351 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  89.71 
 
 
243 aa  434  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  77.54 
 
 
237 aa  345  3e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  69.72 
 
 
234 aa  291  6e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  72.4 
 
 
237 aa  280  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  54.88 
 
 
243 aa  260  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  47.42 
 
 
250 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  41.94 
 
 
211 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  40.31 
 
 
214 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  41.49 
 
 
212 aa  142  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  41.94 
 
 
210 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  43.55 
 
 
209 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  39.59 
 
 
219 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  39.59 
 
 
219 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  38.71 
 
 
211 aa  138  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  40.21 
 
 
200 aa  138  6e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  36.18 
 
 
207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  38.5 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  38 
 
 
219 aa  135  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  39.79 
 
 
219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  39.25 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  38.38 
 
 
210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.11 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.56 
 
 
196 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  36.41 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  39.67 
 
 
201 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  36.82 
 
 
217 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  35.94 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  37.97 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  37.63 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  30.52 
 
 
282 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  37.1 
 
 
201 aa  106  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  35.64 
 
 
203 aa  105  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  36.17 
 
 
203 aa  105  9e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  33.7 
 
 
203 aa  102  8e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  33.16 
 
 
203 aa  101  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  31.47 
 
 
301 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  33 
 
 
283 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  32.63 
 
 
198 aa  96.3  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  31.89 
 
 
196 aa  94  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  34.27 
 
 
206 aa  94  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  33.15 
 
 
200 aa  92.8  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  32.8 
 
 
297 aa  92  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  28.77 
 
 
296 aa  89.7  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  28.57 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  30.61 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  30.14 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  30.16 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  27.18 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  27.18 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  28.25 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  26.67 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  30.81 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  26.27 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  25.77 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  26.67 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  25.93 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  28.49 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  30.32 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  32.43 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  26.05 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  27.5 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  26.79 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.8 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  27.75 
 
 
279 aa  72  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  29.05 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  24.87 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  29.08 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  26.7 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  25.93 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  31.63 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  25.11 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  31.09 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  28.65 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  29.03 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  27.17 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  25.24 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  25.41 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  26.23 
 
 
290 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  24.65 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  27.93 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  25.77 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  28.5 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  29.88 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  29.05 
 
 
285 aa  66.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  29.61 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  27.93 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  24.54 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  27.72 
 
 
292 aa  65.1  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  29.21 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  26.01 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  28.65 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  27.46 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  29.94 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  30.29 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  29.15 
 
 
204 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  24.72 
 
 
206 aa  63.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  23.73 
 
 
257 aa  62  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  27.72 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  25.56 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>