174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0778 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  75.85 
 
 		 213 aa  332  4e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  71.08 
 
 		 214 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  71.57 
 
 		 212 aa  295  3e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  66.02 
 
 		 209 aa  287  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  57.89 
 
 		 211 aa  255  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  62 
 
 		 210 aa  254  5e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  54 
 
 		 207 aa  224  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  51.24 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  47.83 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  47.83 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  55.32 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  46.89 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  47.34 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  42.71 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  47.18 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  49.73 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  45.45 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  46.81 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  46.32 
 
 		 243 aa  157  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  46.99 
 
 		 202 aa  155  6e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  43.08 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  44.09 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  37.63 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  42.08 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  39.29 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  41.99 
 
 		 196 aa  141  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  40.93 
 
 		 283 aa  139  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  37.23 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  38.46 
 
 		 206 aa  134  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  40.11 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  39.04 
 
 		 301 aa  131  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  37.57 
 
 		 203 aa  131  9e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  38.42 
 
 		 296 aa  128  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  37.5 
 
 		 297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  39.89 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  35.64 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.07 
 
 		 243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  35.64 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  36.17 
 
 		 282 aa  122  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  38.42 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  37.93 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  41.38 
 
 		 237 aa  118  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  38.61 
 
 		 250 aa  117  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  34.9 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  38.46 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  32.99 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  33.16 
 
 		 267 aa  102  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  33.03 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  32.12 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  27.84 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  33.18 
 
 		 280 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  30.63 
 
 		 304 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  30.92 
 
 		 288 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  31.55 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  34.13 
 
 		 259 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  28.87 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  33.53 
 
 		 259 aa  89.4  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  33.53 
 
 		 259 aa  89  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.81 
 
 		 249 aa  88.6  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  31.48 
 
 		 273 aa  88.6  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  31.05 
 
 		 290 aa  88.2  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  30.43 
 
 		 249 aa  87.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  28.49 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  31.31 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  30.16 
 
 		 271 aa  86.3  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  32.07 
 
 		 276 aa  85.9  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  28.14 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  28.57 
 
 		 284 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  32.34 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  31.6 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  31.6 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  31.6 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  28.99 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  33.68 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  29.44 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  27.64 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  30.65 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  25.54 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  30.17 
 
 		 283 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  30 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  33.15 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  32.35 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  30.41 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  27.07 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  28.43 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  31.6 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  32.63 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  32.78 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  28.57 
 
 		 263 aa  78.2  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  30 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.85 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.23 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  26.37 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  27.05 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  29.51 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  24.87 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  31.28 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  31.75 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  27.46 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>