90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12142 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12142  proteasome beta subunit prcB  100 
 
 
291 aa  579  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000259602  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  74.5 
 
 
304 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  74.5 
 
 
304 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  74.5 
 
 
304 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  71.72 
 
 
303 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  71.81 
 
 
306 aa  410  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  62.93 
 
 
292 aa  322  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  60.94 
 
 
282 aa  306  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22030  proteasome endopeptidase complex, beta component  57.85 
 
 
289 aa  292  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00409578  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  52.53 
 
 
290 aa  275  7e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  56.98 
 
 
279 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1015  20S proteasome, A and B subunits  56.33 
 
 
282 aa  271  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.410005  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  53.44 
 
 
273 aa  270  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  51.92 
 
 
284 aa  265  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  54.58 
 
 
324 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2682  20S proteasome A and B subunits  56.27 
 
 
280 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  52.71 
 
 
280 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  52.92 
 
 
304 aa  258  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  55.43 
 
 
279 aa  255  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  52.73 
 
 
283 aa  255  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  50.39 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  50.38 
 
 
288 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  50.19 
 
 
274 aa  246  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  51.33 
 
 
302 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  52.85 
 
 
276 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  50.97 
 
 
282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  50.76 
 
 
275 aa  242  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  49.42 
 
 
282 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  55.51 
 
 
288 aa  238  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  48.55 
 
 
285 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  51.17 
 
 
278 aa  235  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  50.97 
 
 
270 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  46.56 
 
 
273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  44.79 
 
 
302 aa  206  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  47.88 
 
 
272 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  46.56 
 
 
280 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  34.97 
 
 
219 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  34.97 
 
 
219 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  30.94 
 
 
219 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  33.88 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  28.64 
 
 
217 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  31.36 
 
 
207 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  31.91 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  31.79 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  30.52 
 
 
212 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  30.6 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  28 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  30.59 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  29.89 
 
 
209 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  31.19 
 
 
225 aa  63.5  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  29.95 
 
 
214 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  29.59 
 
 
217 aa  63.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  28.92 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  28.49 
 
 
187 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  24.37 
 
 
282 aa  55.8  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  28.49 
 
 
267 aa  55.8  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  26.18 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  29.47 
 
 
200 aa  53.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  26.6 
 
 
217 aa  52.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.36 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.37 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.03 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  29.48 
 
 
234 aa  50.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  41.67 
 
 
181 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  26.05 
 
 
201 aa  49.3  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  35.56 
 
 
179 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  30.97 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  24.62 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  27.98 
 
 
203 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  23.96 
 
 
201 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  26.32 
 
 
210 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.48 
 
 
196 aa  46.2  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  36.99 
 
 
179 aa  45.8  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2740  ATP-dependent protease peptidase subunit  31.15 
 
 
176 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  27.42 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  43.59 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  23.44 
 
 
201 aa  43.9  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  21.26 
 
 
199 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  23.96 
 
 
202 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  25.96 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  32.58 
 
 
174 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  25.93 
 
 
197 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  22.92 
 
 
200 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  31.88 
 
 
243 aa  43.1  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  29.86 
 
 
237 aa  43.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2747  ATP-dependent protease peptidase subunit  36.76 
 
 
173 aa  42.7  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  27.08 
 
 
203 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.3 
 
 
210 aa  42.4  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  26.11 
 
 
203 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  26.9 
 
 
272 aa  42.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>