164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0055 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 		 202 aa  408  1e-113  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  83.08 
 
 		 201 aa  357  6e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  81.59 
 
 		 201 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  81.59 
 
 		 200 aa  348  4e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  59.89 
 
 		 206 aa  236  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  54.95 
 
 		 200 aa  191  5e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  46.27 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  46.99 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  45.26 
 
 		 211 aa  154  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  45.79 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  45.36 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  42.55 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  42.93 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  40 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  40.11 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  42.5 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  40 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  40 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  40.96 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  39.44 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  38.89 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  39.89 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  42.62 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  38.66 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  34.43 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.78 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  41.85 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  34.2 
 
 		 204 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  41.44 
 
 		 243 aa  124  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  37.22 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  36.08 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.21 
 
 		 196 aa  117  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  36.46 
 
 		 234 aa  104  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  33.52 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  37.57 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.52 
 
 		 243 aa  99.4  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.72 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  35.43 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  33.33 
 
 		 297 aa  92  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  34.62 
 
 		 272 aa  91.7  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  30.05 
 
 		 282 aa  91.7  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  30.5 
 
 		 296 aa  90.9  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  31.22 
 
 		 301 aa  90.1  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  28.57 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  28.64 
 
 		 233 aa  89  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  30.15 
 
 		 245 aa  88.2  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  33.51 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  34.81 
 
 		 267 aa  86.3  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  31.58 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  35.33 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  26.32 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  28.89 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  33.52 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  34.73 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  34.73 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  36.99 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  27.75 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  28.64 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  33.53 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  26.29 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  29.57 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  32.61 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  29.85 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  30.27 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  26.7 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.16 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  30.27 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  26.13 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  25 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  29.55 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  31.18 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  31.14 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  31.94 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  30.69 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  26.43 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  30.48 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  32.12 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  26.58 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  29.82 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  26.2 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  26.13 
 
 		 242 aa  67.8  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  26.42 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  31.18 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  28.57 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  25.27 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  30.59 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  26.29 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  26.5 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  27.36 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  32.98 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  28.71 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  27.86 
 
 		 273 aa  64.7  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  25.38 
 
 		 272 aa  64.7  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  25.37 
 
 		 290 aa  64.7  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  29.17 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  28.92 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  26.37 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  27.89 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  26.47 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  24.54 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>