74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01080 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  564  1e-160  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  58.82 
 
 
242 aa  263  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  50.45 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  41.44 
 
 
227 aa  186  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  44.13 
 
 
215 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14449  predicted protein  30.18 
 
 
231 aa  98.6  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0963899  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  26.63 
 
 
204 aa  89  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  25.38 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.02 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  27.97 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  22.96 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  26.67 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  21.72 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  22.01 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  25.62 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  29.84 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  22.63 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  24.34 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  27.68 
 
 
214 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  22.73 
 
 
211 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  22.89 
 
 
200 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  30.83 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  24.62 
 
 
201 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  25.38 
 
 
202 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  20.71 
 
 
200 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  23.08 
 
 
201 aa  60.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  24.44 
 
 
219 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  24.44 
 
 
219 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  22 
 
 
217 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  22.43 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  23.7 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  21.39 
 
 
210 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  29.91 
 
 
212 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  23 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  27.61 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  25.59 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  20.71 
 
 
196 aa  56.2  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 
206 aa  55.8  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.69 
 
 
225 aa  55.8  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  27.88 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  28.04 
 
 
210 aa  55.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  22.22 
 
 
219 aa  53.9  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  21.93 
 
 
198 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.61 
 
 
243 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.93 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  21.39 
 
 
210 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  24.48 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  30.65 
 
 
204 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.74 
 
 
243 aa  48.9  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  25.29 
 
 
290 aa  48.9  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  26.87 
 
 
303 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  24.55 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  27.41 
 
 
282 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  22.27 
 
 
280 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  22.97 
 
 
246 aa  46.2  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  26.15 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  24.29 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  30.36 
 
 
232 aa  45.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  24.53 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  25.87 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  21.03 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  22.67 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  25.16 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  26 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  25.74 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  26.04 
 
 
302 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  25.37 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  25.37 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2260  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  26.92 
 
 
817 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  25.37 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12731  predicted protein  25.43 
 
 
227 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  24.17 
 
 
250 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  20.79 
 
 
264 aa  42.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>