28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14449 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_14449  predicted protein  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0963899  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  33.63 
 
 
227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  30.18 
 
 
272 aa  98.6  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  29.6 
 
 
242 aa  92.4  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  30.13 
 
 
261 aa  81.6  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  29.02 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  28.93 
 
 
204 aa  62.4  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  27.54 
 
 
203 aa  58.9  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  29.41 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  30.39 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  30.39 
 
 
203 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  27.12 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  28.85 
 
 
196 aa  52.4  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  24.26 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  26.83 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.12 
 
 
210 aa  49.7  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  24.66 
 
 
206 aa  49.3  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  25.42 
 
 
209 aa  48.9  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  26.19 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  23.53 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  24.03 
 
 
200 aa  45.4  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  22.13 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  26.29 
 
 
200 aa  43.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.49 
 
 
196 aa  43.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  23.89 
 
 
217 aa  42  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  20.98 
 
 
211 aa  42.4  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  26.54 
 
 
234 aa  42  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  22.78 
 
 
219 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>