75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_62487 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  71.35 
 
 		 192 aa  303  9.000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  62.44 
 
 		 210 aa  278  5e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  58.29 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  49.26 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12731  predicted protein  31.28 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  27.84 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  27.37 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  27.81 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  25.26 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  28.12 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  27.37 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  24.87 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  22.68 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  24.59 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  25.93 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  24.62 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  24.47 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  27.23 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  25.38 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  23.5 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  26.15 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  24.23 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.84 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  24.48 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  24.58 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  23.16 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  24.21 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  24.21 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.6 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  23.68 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.51 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  26.11 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  27.01 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  30.83 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  24.34 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  26.58 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.26 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.5 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  23.59 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  24.1 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  24.1 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  26.02 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  27.17 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  23.37 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  25.56 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  27.08 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  24.58 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  29.28 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  22.04 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  25.27 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10708  hypothetical proteasome beta 7 subunit (Eurofung)  29.08 
 
 		 260 aa  52.4  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04990  proteasome subunit beta type 2, putative  24.79 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.846923  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04457  20S proteasome beta-type subunit (Eurofung)  20.97 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0477671  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  24.23 
 
 		 233 aa  51.6  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  23.43 
 
 		 302 aa  51.6  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  24.73 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  23.53 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14449  predicted protein  24.66 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0963899  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  24.1 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  23.23 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  23.43 
 
 		 282 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  23.56 
 
 		 297 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  22.63 
 
 		 282 aa  46.2  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  25.7 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  23.94 
 
 		 301 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  22.4 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  25.53 
 
 		 283 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89662  B-type subunit of proteasome  25.76 
 
 		 281 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.596472 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  23.3 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  23.73 
 
 		 259 aa  41.6  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  23.73 
 
 		 259 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  23.96 
 
 		 272 aa  41.6  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>