46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89662 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_89662  B-type subunit of proteasome  100 
 
 		 281 aa  585  1e-166  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.596472 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10708  hypothetical proteasome beta 7 subunit (Eurofung)  46.95 
 
 		 260 aa  261  8e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02950  endopeptidase, putative  42.71 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0631891  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31764  predicted protein  33.48 
 
 		 289 aa  157  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0071372 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  25.49 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  27.41 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  28.49 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.42 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  26.9 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  25.12 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  24.75 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  24.75 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  23.19 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  24.62 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  26.53 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  26.53 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  24.87 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  25.76 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  26.53 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  23.83 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  24.5 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.96 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.75 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  22.32 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  26.42 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  25.57 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  24.88 
 
 		 250 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  26.01 
 
 		 243 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  23.44 
 
 		 202 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  22.08 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  23.47 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  22.6 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  21.89 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  26.21 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  25.54 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  21.5 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  24.82 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  22.16 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  20.2 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  24.82 
 
 		 200 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  27.2 
 
 		 204 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  25.76 
 
 		 206 aa  43.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  23.28 
 
 		 206 aa  42.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  36.67 
 
 		 217 aa  42.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  27.08 
 
 		 288 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  29.17 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>