74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30003 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  58.29 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  56.19 
 
 		 210 aa  248  3e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  55.73 
 
 		 192 aa  232  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  52.91 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12731  predicted protein  36.28 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  30.57 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  30.37 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  29.02 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  30.85 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  35 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  27.46 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  30.65 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  30.41 
 
 		 212 aa  87.8  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  28.88 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  30.07 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  27.49 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  27.92 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  29.26 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  26.06 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  26.2 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  26.2 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  26.15 
 
 		 217 aa  77.8  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  26.2 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  30.56 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.65 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  24.06 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  25.38 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  26.2 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.84 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  31.22 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  23.24 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  27.81 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  29.79 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  23.78 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  26.23 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  32.31 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  28.96 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.34 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.47 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  26.42 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.27 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  23.63 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  23.86 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  30.65 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  26.11 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  30.86 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  22.78 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  25.39 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  24.55 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10708  hypothetical proteasome beta 7 subunit (Eurofung)  30 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  26.29 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  24.21 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  29.46 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  26.16 
 
 		 283 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  24.38 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  26.46 
 
 		 297 aa  52.4  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  28.28 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89662  B-type subunit of proteasome  27.2 
 
 		 281 aa  50.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.596472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  25.25 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  26.26 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  26.84 
 
 		 282 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  24.46 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  22.61 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31764  predicted protein  28.95 
 
 		 289 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0071372 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  23.46 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27881  predicted protein  23.79 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115527 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  24.88 
 
 		 283 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  24.87 
 
 		 302 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  25.56 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04990  proteasome subunit beta type 2, putative  25.64 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.846923  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  23.72 
 
 		 302 aa  42.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  23.71 
 
 		 282 aa  42.4  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04457  20S proteasome beta-type subunit (Eurofung)  19.39 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0477671  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>