58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA03730 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  100 
 
 		 210 aa  435  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  62.44 
 
 		 206 aa  278  5e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  58.88 
 
 		 192 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  56.19 
 
 		 204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  50 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12731  predicted protein  34.36 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  27.08 
 
 		 203 aa  85.1  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  26.29 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.92 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  24.75 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  24.62 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  25.52 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  24.87 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  25.89 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  25.27 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  27.59 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  33.96 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  25.81 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  23.15 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  21.65 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  24.87 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  24.87 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  23.86 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.04 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  24.37 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  21 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  22.28 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.84 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  22.68 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  31.58 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  21.24 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  23.71 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  23.23 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.42 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  23.91 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  28.04 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  28.88 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  24.19 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.81 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  27.55 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  22.46 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  22.06 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.42 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  26.85 
 
 		 242 aa  48.5  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  20.65 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  23.76 
 
 		 297 aa  48.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  21.67 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  25.85 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  21.65 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  19.6 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  22.98 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  22.28 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  23.53 
 
 		 272 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  24.77 
 
 		 264 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  22.1 
 
 		 301 aa  43.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  22.1 
 
 		 282 aa  42.4  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  22.22 
 
 		 296 aa  42  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>