128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19004 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  100 
 
 		 250 aa  512  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  54.13 
 
 		 289 aa  275  5e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  55.37 
 
 		 258 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  50.45 
 
 		 233 aa  227  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  54.26 
 
 		 246 aa  226  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  45.53 
 
 		 259 aa  186  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  45.11 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  44.68 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  43.88 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  41.3 
 
 		 243 aa  178  8e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  42.21 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  43.66 
 
 		 248 aa  175  8e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  43.94 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  44.88 
 
 		 243 aa  169  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  43.56 
 
 		 242 aa  168  7e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  45.59 
 
 		 238 aa  168  8e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  39.84 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  41.49 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  44.12 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  37.55 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  42.65 
 
 		 263 aa  162  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  42.27 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  43.94 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  39.23 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  40.83 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  40.83 
 
 		 240 aa  159  6e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  37.71 
 
 		 241 aa  158  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  41.94 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  41.95 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  41.18 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  41.87 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  46.41 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  40.59 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  35.8 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  36.44 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  43.65 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  42.57 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  39.47 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  35.8 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  35.32 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  34.48 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  34.69 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  39.59 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  34.58 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  36.06 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  36.63 
 
 		 250 aa  136  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  32.2 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  36.23 
 
 		 270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  32.22 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  38.25 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  36.15 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  33.64 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  33.02 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  35.74 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  38.12 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  32.63 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  32.88 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  33.91 
 
 		 269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  36.22 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  33 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  33.33 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  32.49 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  31.75 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  31.74 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  36.6 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  31.49 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  30.04 
 
 		 245 aa  102  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  39.1 
 
 		 298 aa  99.4  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  34.56 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  29.59 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  31.37 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  32.58 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  29.65 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  32.77 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  30.56 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  32.56 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  31.46 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  27.59 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  28.37 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  27.91 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  27.33 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  27.11 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  27.11 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  30.23 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  28 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  25.89 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  27.94 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  27.93 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  26.22 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  27.49 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  26.22 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  24.73 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  25.62 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  25.56 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  30.06 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  27.91 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  23.91 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  28.07 
 
 		 192 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  27.67 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.57 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>