73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_5685 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  100 
 
 
258 aa  533  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  44.64 
 
 
298 aa  226  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  46.53 
 
 
250 aa  209  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  43.57 
 
 
256 aa  192  4e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  39.59 
 
 
238 aa  179  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  38.34 
 
 
272 aa  125  9e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  34.09 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  31.37 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  38.42 
 
 
259 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  33.64 
 
 
259 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  33.19 
 
 
239 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  33.78 
 
 
253 aa  118  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  33.04 
 
 
243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  34.36 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  32.3 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  37.85 
 
 
240 aa  112  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  37.29 
 
 
271 aa  112  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  37.5 
 
 
240 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  36.16 
 
 
241 aa  111  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  35.43 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  33.93 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  36.47 
 
 
249 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  32.76 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  34.01 
 
 
240 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  33.33 
 
 
240 aa  108  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  38.46 
 
 
254 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  33.33 
 
 
245 aa  105  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  30.04 
 
 
240 aa  105  9e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  29.46 
 
 
268 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  33.15 
 
 
247 aa  103  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  32.02 
 
 
248 aa  102  7e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  34.09 
 
 
249 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  33.15 
 
 
256 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  36.36 
 
 
235 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  36.36 
 
 
238 aa  100  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  34.46 
 
 
250 aa  99.4  6e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  34.66 
 
 
250 aa  99  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  34.09 
 
 
251 aa  99  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  32.84 
 
 
241 aa  98.6  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  32.38 
 
 
245 aa  98.6  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  34.66 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  30.9 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  33.33 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  34.29 
 
 
271 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  34.66 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  30.49 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  32.97 
 
 
242 aa  96.3  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  33.52 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  33.51 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  32.58 
 
 
251 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  33.15 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  32.63 
 
 
299 aa  92.8  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  30.3 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  31.88 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  34.81 
 
 
236 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  30.1 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  30.81 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  27.91 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  29.15 
 
 
243 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  31.38 
 
 
270 aa  87  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  32.97 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  31.37 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  32.98 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  27.95 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  28.57 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  29.85 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  31.1 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  29.65 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  28.85 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  25.99 
 
 
180 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  24.82 
 
 
246 aa  55.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  24.86 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  24.86 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>