86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27508 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  100 
 
 		 269 aa  554  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  99.16 
 
 		 250 aa  486  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  48.44 
 
 		 259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  46.09 
 
 		 299 aa  238  9e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  49.54 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  41.84 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  37.79 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  40.1 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  38.38 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  37.38 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  41 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  35.55 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  36.86 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  43.1 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  33.33 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  38.94 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  37.85 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  38.05 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  41.67 
 
 		 241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  37.21 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  42.53 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  37.38 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  36.28 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  37.33 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  38.97 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  38.38 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  38.79 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  39.06 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  40.33 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  36.29 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  41.38 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  37.81 
 
 		 249 aa  122  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  39.55 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  35.07 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  39.66 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  39.34 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  37.56 
 
 		 240 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  35.06 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  33.33 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  34.18 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  38.37 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  33.88 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  33.91 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  34.47 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  34.56 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  36.57 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  37.91 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  37.36 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  30.33 
 
 		 235 aa  109  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  39.29 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  35.2 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  35.05 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  32.09 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  37.65 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  36.42 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  36.36 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  32.16 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  31.38 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  33.15 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  34.66 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  30.24 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  29.71 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  29.92 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  36.42 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  30.2 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  29.41 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  30.7 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  29.32 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  28.79 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  31.43 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  29.48 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  30.11 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  29.55 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  30.73 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  32.02 
 
 		 203 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  27.32 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  28.74 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.38 
 
 		 196 aa  46.6  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  29.84 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  26.64 
 
 		 219 aa  46.2  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  27.68 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  33.1 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  25.79 
 
 		 204 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04990  proteasome subunit beta type 2, putative  27.27 
 
 		 224 aa  42  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.846923  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  25.39 
 
 		 196 aa  42  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  27.5 
 
 		 207 aa  42  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>