91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_41423 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  100 
 
 		 247 aa  509  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  64.98 
 
 		 254 aa  351  5e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  55 
 
 		 256 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  49.39 
 
 		 246 aa  253  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  46.15 
 
 		 245 aa  222  4e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  36.84 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  35.51 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  35.51 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  39.32 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  35.1 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  38.3 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  36.02 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  35.9 
 
 		 248 aa  132  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  37.18 
 
 		 251 aa  131  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  35.87 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  35.29 
 
 		 242 aa  131  9e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  31.85 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  35.56 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  36.68 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  34.76 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  33.05 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  40.86 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  33.74 
 
 		 271 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  32.22 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  35.06 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  33.79 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  32.49 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  33.48 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  35.04 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  37.17 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  33.61 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  31.91 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  33.83 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  32.64 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  34.62 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  30.86 
 
 		 240 aa  119  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  33.05 
 
 		 268 aa  118  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  31.93 
 
 		 245 aa  118  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  36.27 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  37.36 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  34.96 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  33.05 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  36.14 
 
 		 271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  37.99 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  28.86 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  34.63 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  34 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  35.75 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  33.7 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  32.49 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  28.83 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  28.88 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  28.46 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  37.85 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  28.97 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  32.26 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  33.15 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  28.69 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  28.92 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  31.69 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 280 aa  96.3  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  30.62 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  32.88 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  30.22 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  29.22 
 
 		 299 aa  89.4  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  31.07 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  31.07 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  26.09 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  27.36 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  29.27 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  27.17 
 
 		 246 aa  62  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  27.53 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  26.57 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  27.52 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  27.52 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  26.77 
 
 		 200 aa  52  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  27.06 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  25.49 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  28.17 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  27.36 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  25.87 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  24.17 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.71 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  26.92 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  26.49 
 
 		 198 aa  45.8  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  24.38 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.88 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  23.5 
 
 		 200 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  22.77 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  27.68 
 
 		 214 aa  42.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 		 204 aa  42  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>