125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2401 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  76.45 
 
 		 271 aa  386  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  76.52 
 
 		 256 aa  384  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  76.52 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  71.9 
 
 		 267 aa  354  5.999999999999999e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  68.85 
 
 		 247 aa  352  4e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  66.26 
 
 		 245 aa  324  7e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  65.83 
 
 		 249 aa  324  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  59.74 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  52.94 
 
 		 240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  51.91 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  52.54 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  50.42 
 
 		 241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  50.86 
 
 		 249 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  50.87 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  50 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  50.66 
 
 		 240 aa  224  7e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  50.64 
 
 		 259 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  50.21 
 
 		 259 aa  218  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  50.21 
 
 		 259 aa  218  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  52.07 
 
 		 259 aa  216  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  52.86 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  51.63 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  48.07 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  47.21 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  50 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  51.04 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  41.92 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  44.59 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  45.69 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  45.76 
 
 		 245 aa  184  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  45.29 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  45.61 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  48.86 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  44.35 
 
 		 241 aa  183  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  44.21 
 
 		 240 aa  182  6e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  44.24 
 
 		 270 aa  181  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  46.19 
 
 		 289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  40.43 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  46.91 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  45.96 
 
 		 231 aa  161  7e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  42.18 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  36.24 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  41.71 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  39.37 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  42.57 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  45.86 
 
 		 233 aa  148  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  37.61 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  35.54 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  34.32 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  33.2 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  35.06 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  40.34 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  40.32 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  37.22 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  37.21 
 
 		 256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  33.61 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  38.79 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  38.79 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  40.12 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  39.53 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  34.07 
 
 		 298 aa  118  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  34.96 
 
 		 247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  42.29 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  33.66 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  36.07 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  33.33 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  34.66 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  30.26 
 
 		 236 aa  96.7  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  28.63 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  29.38 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  27.81 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  30.7 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  26.09 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  32.84 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  26.21 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  29.68 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  29.68 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  26.32 
 
 		 212 aa  72  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  27.8 
 
 		 217 aa  72  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  28.77 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  27.88 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  27.88 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  29.47 
 
 		 201 aa  68.6  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  26.7 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  27.84 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.84 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  26.99 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  26.98 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  29.38 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  29.47 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  28.87 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.5 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  28.12 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  27.06 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  27.62 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.8 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  26.01 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  27.42 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  28.09 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>