114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61383 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  100 
 
 		 250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  64.18 
 
 		 298 aa  339  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  55.79 
 
 		 256 aa  274  8e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  46.19 
 
 		 238 aa  220  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  45.49 
 
 		 258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  41.28 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  38.99 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  37.14 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  42.11 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  41.55 
 
 		 272 aa  155  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  40.5 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  38.5 
 
 		 240 aa  152  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  38.07 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  41.03 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  38.14 
 
 		 248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  36.84 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  38.1 
 
 		 259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  37.44 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  39.11 
 
 		 240 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  40.7 
 
 		 238 aa  144  9e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  41.34 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  39.25 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  40.78 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  38 
 
 		 241 aa  142  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  36.41 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  34.33 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  42.31 
 
 		 271 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  39.55 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  38.16 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  35.48 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  37.71 
 
 		 249 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  38.98 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  35.87 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  37.43 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  37.17 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  34.76 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  38.8 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  37.22 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  37.5 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  35.78 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  35.26 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  36.36 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  34.76 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  38.62 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  33.83 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  36.23 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  37.82 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  36.15 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  36.32 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  34.95 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  36.72 
 
 		 240 aa  120  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  30.48 
 
 		 268 aa  118  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  32.09 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  32.23 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  33.78 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  33.8 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  36.78 
 
 		 299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  33.33 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  37.5 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  37.71 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  29.79 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  37.85 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  34.95 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  30.21 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  35.59 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  36.42 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  36.42 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  30.65 
 
 		 280 aa  96.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  30.43 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  33.72 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  33.33 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  32.16 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  30.23 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  29.48 
 
 		 203 aa  72  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  27.67 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  28.65 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  27.13 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  31.21 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  29.82 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  26.34 
 
 		 210 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  29.82 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  29.82 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  27.6 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  26.83 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  26.59 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  28.32 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  26.11 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  30.18 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.14 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.23 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  26.59 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  32.16 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  31.52 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  29.14 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  28.83 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  29.14 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  25.14 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.84 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  26.44 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  29.14 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>