175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0083 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 		 207 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  66.49 
 
 		 210 aa  264  7e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  60.1 
 
 		 211 aa  258  4e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  59.38 
 
 		 214 aa  236  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  56 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  54 
 
 		 211 aa  224  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  55.56 
 
 		 209 aa  221  8e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  49.51 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  51.98 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  49.03 
 
 		 219 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  49.03 
 
 		 219 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  48.54 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  52.58 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  47.64 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  42.41 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  43.52 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  40.43 
 
 		 210 aa  153  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  40.61 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  44.44 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  41.84 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  40.7 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  36.65 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  39.04 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  37.63 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  39.89 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  37.7 
 
 		 203 aa  138  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  39.39 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  35.48 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  36.65 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  38.66 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  40.44 
 
 		 201 aa  131  6e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  39.43 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  37.78 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  34.16 
 
 		 283 aa  125  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  35.11 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  35.52 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  36.07 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  35.02 
 
 		 284 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  34.85 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.78 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  35.48 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  37.57 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  31.68 
 
 		 297 aa  112  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  32.04 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  32.52 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  32.52 
 
 		 259 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  32.52 
 
 		 259 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  31.38 
 
 		 282 aa  105  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  35.48 
 
 		 250 aa  104  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  34.26 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  30.52 
 
 		 278 aa  99  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  36.84 
 
 		 285 aa  96.7  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  34.97 
 
 		 276 aa  95.9  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  33.16 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  32.98 
 
 		 290 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  31.02 
 
 		 273 aa  93.6  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  33.18 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  34.08 
 
 		 273 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  32.08 
 
 		 302 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  31.07 
 
 		 267 aa  91.3  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  31.14 
 
 		 271 aa  90.9  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  31.75 
 
 		 280 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  30 
 
 		 272 aa  90.1  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  28.71 
 
 		 296 aa  89.4  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  29.79 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  30.63 
 
 		 304 aa  89  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  32.34 
 
 		 248 aa  88.2  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  29.61 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  30.69 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  32.23 
 
 		 272 aa  86.3  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  26.92 
 
 		 263 aa  85.9  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  30.45 
 
 		 274 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  28.96 
 
 		 279 aa  85.5  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  29.65 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  27.54 
 
 		 249 aa  85.1  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  32.39 
 
 		 283 aa  84.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  32.98 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  36.22 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  33.89 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  32.73 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  36.13 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  32.48 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  35.33 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  30 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  29.95 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  30.32 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  28.02 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  27.91 
 
 		 241 aa  81.3  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  26.49 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  30.11 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  28.31 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  30.46 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  27.37 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  26.11 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  28.82 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  26.79 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  32.73 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  32.73 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  32.73 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  26.96 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>