86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_5889 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  100 
 
 
180 aa  373  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  36.46 
 
 
240 aa  121  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  38.98 
 
 
251 aa  121  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  37.85 
 
 
259 aa  121  6e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  36.72 
 
 
259 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  36.72 
 
 
259 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  37.85 
 
 
256 aa  118  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  36.36 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  38.64 
 
 
249 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  33.7 
 
 
271 aa  115  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  36.72 
 
 
247 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  35.06 
 
 
238 aa  111  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  33.7 
 
 
272 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  33.52 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  36.72 
 
 
245 aa  108  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  32.77 
 
 
241 aa  109  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  32.2 
 
 
258 aa  107  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  36.07 
 
 
250 aa  107  7.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  38.18 
 
 
267 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  35.23 
 
 
242 aa  106  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  33.52 
 
 
240 aa  106  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  35.03 
 
 
271 aa  104  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  36.6 
 
 
250 aa  103  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  32.39 
 
 
249 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  34.66 
 
 
243 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  29.55 
 
 
289 aa  102  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  32 
 
 
245 aa  102  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  33.52 
 
 
240 aa  101  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  32.39 
 
 
263 aa  101  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  35.8 
 
 
251 aa  101  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  35.23 
 
 
241 aa  100  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  33.71 
 
 
240 aa  99.4  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  42.96 
 
 
280 aa  99.4  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  33.88 
 
 
268 aa  99  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  35.23 
 
 
248 aa  97.8  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  31.82 
 
 
241 aa  97.4  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  32.39 
 
 
240 aa  97.1  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  31.25 
 
 
243 aa  95.1  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  30.86 
 
 
259 aa  90.5  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  31.07 
 
 
252 aa  87.4  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  29.21 
 
 
250 aa  84.3  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  31.43 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  31.43 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  29.31 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  29.88 
 
 
233 aa  82  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  31.15 
 
 
299 aa  81.6  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  29.55 
 
 
235 aa  81.3  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  28.08 
 
 
278 aa  81.3  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  27.17 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  30.22 
 
 
256 aa  78.2  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  28.89 
 
 
256 aa  78.2  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  28.25 
 
 
255 aa  77.8  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  29.05 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  29.38 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  28.96 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  28.42 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  28.81 
 
 
264 aa  71.2  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  26.37 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  26.37 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  25.26 
 
 
285 aa  68.2  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  26.55 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  27.6 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  28.69 
 
 
246 aa  63.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  27.53 
 
 
247 aa  60.8  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  29.48 
 
 
233 aa  60.1  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  27.41 
 
 
298 aa  57.8  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  28.15 
 
 
238 aa  57  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  25.42 
 
 
236 aa  57.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  25.99 
 
 
258 aa  57  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  27.43 
 
 
254 aa  55.8  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  25.86 
 
 
245 aa  55.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  26.97 
 
 
246 aa  53.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  29.46 
 
 
219 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  29.03 
 
 
219 aa  49.3  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  28.68 
 
 
219 aa  48.5  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  28.68 
 
 
219 aa  48.5  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  26.02 
 
 
207 aa  45.1  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  23.62 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  25.83 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  26.36 
 
 
215 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  24.17 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  25 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  27.05 
 
 
217 aa  42.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  23.33 
 
 
203 aa  42  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 
203 aa  42.4  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  25.64 
 
 
272 aa  41.6  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>