98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04280 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  100 
 
 		 252 aa  518  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  60.49 
 
 		 235 aa  301  7.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  57.14 
 
 		 278 aa  295  6e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  59.83 
 
 		 236 aa  284  8e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  55.97 
 
 		 250 aa  281  5.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  40.42 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  38.43 
 
 		 240 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  39.15 
 
 		 253 aa  155  8e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  35.39 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  38.84 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  38.93 
 
 		 241 aa  152  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  37.45 
 
 		 239 aa  151  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  38.68 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  39.53 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  37.34 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  37.74 
 
 		 271 aa  149  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  39.22 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  37.21 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  37.4 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  36.74 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  38.39 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  34.98 
 
 		 271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  36.62 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  36.28 
 
 		 259 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  36.74 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  35.95 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  32.64 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  33.2 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  34.96 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  35.93 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  35.25 
 
 		 241 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  37.31 
 
 		 247 aa  138  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  37.26 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  41.11 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  31.87 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  35.68 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  33.87 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  38.5 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  33.74 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  36.57 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  35.22 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  32.3 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  34.18 
 
 		 285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  35.98 
 
 		 237 aa  129  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  29.8 
 
 		 257 aa  128  8.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  37.91 
 
 		 240 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  33.8 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  31.73 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  33.02 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  38.89 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  30 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  30.8 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  31.94 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  36.32 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  30.57 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  30.86 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  33.33 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  32.49 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  35.2 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  35.23 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  35.42 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  28.46 
 
 		 247 aa  105  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  32.57 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  27.1 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  31.75 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  28.29 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  31.64 
 
 		 269 aa  93.2  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  31.64 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  30.81 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  31.07 
 
 		 180 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  28.17 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  30.41 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  28.42 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.5 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  26.71 
 
 		 204 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  29.24 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  29.17 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  28.16 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.9 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  27.54 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  25.73 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  28.57 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  27.38 
 
 		 201 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  26.79 
 
 		 200 aa  49.3  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.16 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  24.89 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  25.24 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  26.19 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  23.88 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  20.93 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  25.88 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  20.51 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2646  20S proteasome, A and B subunits  23.46 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.786174  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  23.63 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  22.55 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  24.54 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  25.9 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  24.4 
 
 		 198 aa  42.4  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>