46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2646 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2646  20S proteasome, A and B subunits  100 
 
 		 255 aa  509  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.786174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1789  putative 20S proteasome alpha-subunit  62.01 
 
 		 249 aa  291  7e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1189  20S proteasome, A and B subunits  65.8 
 
 		 234 aa  291  7e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.431495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2312  20S proteasome A and B subunits  66.38 
 
 		 228 aa  287  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2427  20S proteasome A and B subunits  64.81 
 
 		 292 aa  285  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0676783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1874  20S proteasome A and B subunits  67.29 
 
 		 237 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1489  20S proteasome A and B subunits  65.74 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20860  20S proteasome subunit (alpha or beta)  59.38 
 
 		 255 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1496  20S proteasome A and B subunits  58.52 
 
 		 251 aa  271  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2626  20S proteasome, A and B subunits  59.75 
 
 		 238 aa  271  9e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1831  20S proteasome subunits AB  55.6 
 
 		 276 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4878  20S proteasome A and B subunits  57.32 
 
 		 239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2000  20S proteasome A and B subunits  68.1 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.184278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2362  20S proteasome A and B subunits  56.32 
 
 		 273 aa  262  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674548  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1920  20S proteasome A and B subunits  58.47 
 
 		 236 aa  261  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3448  20S proteasome, A and B subunits  56 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3140  20S proteasome, A and B subunits  57.63 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3190  20S proteasome, A and B subunits  57.63 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617763  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3129  20S proteasome, A and B subunits  57.63 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2245  20S proteasome, A and B subunits  60.09 
 
 		 260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4460  20S proteasome A and B subunits  54.02 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190123  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2683  20S proteasome A and B subunits  59.07 
 
 		 287 aa  257  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2177  20S proteasome, A and B subunits  57.87 
 
 		 235 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017271  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3078  20S proteasome, A and B subunits  58.8 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.136631 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12141  proteasome alpha subunit prcA  57.2 
 
 		 248 aa  255  5e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5870  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  57.48 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2242  20S proteasome A and B subunits  59.62 
 
 		 263 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22020  20S proteasome subunit (alpha or beta)  54.81 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1205  20S proteasome A and B subunits  56.6 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2968  20S proteasome A and B subunits  55.04 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000852426  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2160  20S proteasome A and B subunits  53.47 
 
 		 242 aa  221  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2464  20S proteasome A and B subunits  54.55 
 
 		 262 aa  221  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0911  20S proteasome A and B subunits  52.16 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0394766  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  71.79 
 
 		 690 aa  218  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  22.93 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  24.02 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  20.85 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  22.37 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  22.47 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  22.73 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  23.46 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  23.21 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  25.76 
 
 		 268 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  22.37 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  21.96 
 
 		 211 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  23.79 
 
 		 236 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>