41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2245 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2245  20S proteasome, A and B subunits  100 
 
 		 260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2362  20S proteasome A and B subunits  86.81 
 
 		 273 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674548  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4460  20S proteasome A and B subunits  64.34 
 
 		 265 aa  348  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190123  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22020  20S proteasome subunit (alpha or beta)  65.67 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2683  20S proteasome A and B subunits  61.09 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3448  20S proteasome, A and B subunits  57.83 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4878  20S proteasome A and B subunits  60.25 
 
 		 239 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1789  putative 20S proteasome alpha-subunit  59.57 
 
 		 249 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2242  20S proteasome A and B subunits  64.53 
 
 		 263 aa  281  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1831  20S proteasome subunits AB  60 
 
 		 276 aa  280  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12141  proteasome alpha subunit prcA  59.32 
 
 		 248 aa  279  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3190  20S proteasome, A and B subunits  60.78 
 
 		 250 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617763  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3140  20S proteasome, A and B subunits  60.78 
 
 		 250 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3129  20S proteasome, A and B subunits  60.78 
 
 		 250 aa  278  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1189  20S proteasome, A and B subunits  64.07 
 
 		 234 aa  276  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.431495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2626  20S proteasome, A and B subunits  59.66 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1489  20S proteasome A and B subunits  62.5 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1496  20S proteasome A and B subunits  57.58 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3078  20S proteasome, A and B subunits  61.21 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.136631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2312  20S proteasome A and B subunits  57.76 
 
 		 228 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2968  20S proteasome A and B subunits  57.98 
 
 		 269 aa  262  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000852426  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1874  20S proteasome A and B subunits  59.23 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2646  20S proteasome, A and B subunits  59.91 
 
 		 255 aa  259  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.786174  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1920  20S proteasome A and B subunits  54.04 
 
 		 236 aa  258  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5870  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  58.3 
 
 		 257 aa  258  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20860  20S proteasome subunit (alpha or beta)  57.85 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2464  20S proteasome A and B subunits  56.23 
 
 		 262 aa  244  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2000  20S proteasome A and B subunits  60 
 
 		 244 aa  240  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.184278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2177  20S proteasome, A and B subunits  51.91 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2160  20S proteasome A and B subunits  57.44 
 
 		 242 aa  238  6.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2427  20S proteasome A and B subunits  55.17 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0676783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1205  20S proteasome A and B subunits  53.3 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  64.52 
 
 		 690 aa  201  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0911  20S proteasome A and B subunits  46.15 
 
 		 232 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0394766  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  30.99 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  29.82 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  26.14 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  26.18 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  27.59 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  27.78 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  26.09 
 
 		 204 aa  42  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>