126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2526 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  80.42 
 
 		 240 aa  410  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  79.58 
 
 		 240 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  80.17 
 
 		 239 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  68.42 
 
 		 272 aa  358  3e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  70.59 
 
 		 249 aa  347  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  67.81 
 
 		 240 aa  335  5e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  64.71 
 
 		 263 aa  322  3e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  57.14 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  57.58 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  57.14 
 
 		 259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  57.14 
 
 		 259 aa  271  6e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  57.87 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  53.36 
 
 		 271 aa  265  4e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  52.7 
 
 		 249 aa  264  7e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  51.26 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  52.1 
 
 		 256 aa  251  8.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  50.42 
 
 		 271 aa  250  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  50 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  50.42 
 
 		 250 aa  245  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  50 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  47.92 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  47.68 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  48.54 
 
 		 238 aa  222  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  46.64 
 
 		 242 aa  221  7e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  44.58 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  47.69 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  46.98 
 
 		 243 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  47.19 
 
 		 268 aa  211  5.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  44.87 
 
 		 241 aa  207  9e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  44.92 
 
 		 245 aa  205  6e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  44.02 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  43.75 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  43.51 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  44.5 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  42.37 
 
 		 246 aa  185  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  39.5 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  42.31 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  39.04 
 
 		 240 aa  175  7e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  43.75 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  42.19 
 
 		 289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  39.93 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  42.27 
 
 		 250 aa  161  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  40.67 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  37.44 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  44.56 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  35.06 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  40.5 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  38.93 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  33.74 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  37.5 
 
 		 256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  32.85 
 
 		 278 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  33.99 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  35.22 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  40.1 
 
 		 299 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  37.61 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  33.2 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  36.74 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  33.74 
 
 		 298 aa  135  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  33.33 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  33.05 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  33.47 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  35.03 
 
 		 299 aa  119  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  34.18 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  34.47 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  36.16 
 
 		 258 aa  111  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  30.43 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  32.77 
 
 		 180 aa  109  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  30.21 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  38.86 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  33.05 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  27.94 
 
 		 211 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  28.18 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  30.86 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  28.18 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  28.18 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  32.11 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  29.71 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  27.91 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.9 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  28.96 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  29.59 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  31.61 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  28.24 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  28.71 
 
 		 210 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.77 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  30.41 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  26.47 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  29.7 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  29.07 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  28.71 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  27.49 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  28.92 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.86 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  27.06 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  27.81 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  28.82 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  23.89 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  26.04 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  24.26 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>