42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2362 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2362  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 		 273 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674548  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2245  20S proteasome, A and B subunits  95.15 
 
 		 260 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4460  20S proteasome A and B subunits  63.6 
 
 		 265 aa  345  6e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190123  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2683  20S proteasome A and B subunits  59.93 
 
 		 287 aa  294  9e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22020  20S proteasome subunit (alpha or beta)  65.24 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1789  putative 20S proteasome alpha-subunit  60 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3448  20S proteasome, A and B subunits  59.83 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4878  20S proteasome A and B subunits  60.25 
 
 		 239 aa  279  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2626  20S proteasome, A and B subunits  61.34 
 
 		 238 aa  278  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1189  20S proteasome, A and B subunits  64.94 
 
 		 234 aa  276  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.431495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2242  20S proteasome A and B subunits  63.25 
 
 		 263 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12141  proteasome alpha subunit prcA  57.68 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3190  20S proteasome, A and B subunits  59.48 
 
 		 250 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617763  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3140  20S proteasome, A and B subunits  59.48 
 
 		 250 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3129  20S proteasome, A and B subunits  59.48 
 
 		 250 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1489  20S proteasome A and B subunits  62.93 
 
 		 244 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1496  20S proteasome A and B subunits  58.44 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1831  20S proteasome subunits AB  54.35 
 
 		 276 aa  268  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2968  20S proteasome A and B subunits  58.82 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000852426  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2646  20S proteasome, A and B subunits  60.34 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.786174  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3078  20S proteasome, A and B subunits  59.48 
 
 		 251 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.136631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1874  20S proteasome A and B subunits  59.66 
 
 		 237 aa  258  9e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2312  20S proteasome A and B subunits  58.19 
 
 		 228 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20860  20S proteasome subunit (alpha or beta)  57.61 
 
 		 255 aa  255  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5870  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  57.25 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1920  20S proteasome A and B subunits  53.62 
 
 		 236 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2000  20S proteasome A and B subunits  61.74 
 
 		 244 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.184278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2464  20S proteasome A and B subunits  57.03 
 
 		 262 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2160  20S proteasome A and B subunits  58.68 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2177  20S proteasome, A and B subunits  51.49 
 
 		 235 aa  238  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2427  20S proteasome A and B subunits  54.44 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0676783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1205  20S proteasome A and B subunits  54.72 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  65.16 
 
 		 690 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0911  20S proteasome A and B subunits  47.3 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0394766  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  30.99 
 
 		 203 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  29.14 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  28.4 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  29.24 
 
 		 203 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  27.78 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  25.25 
 
 		 212 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  24.78 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  25.65 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>