38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12141 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12141  proteasome alpha subunit prcA  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000936858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3448  20S proteasome, A and B subunits  81.3 
 
 		 254 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3129  20S proteasome, A and B subunits  82.48 
 
 		 250 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3078  20S proteasome, A and B subunits  81.45 
 
 		 251 aa  391  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.136631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3140  20S proteasome, A and B subunits  82.48 
 
 		 250 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3190  20S proteasome, A and B subunits  82.48 
 
 		 250 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617763  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22020  20S proteasome subunit (alpha or beta)  61.28 
 
 		 255 aa  285  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2242  20S proteasome A and B subunits  63.98 
 
 		 263 aa  278  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2362  20S proteasome A and B subunits  57.68 
 
 		 273 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674548  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2245  20S proteasome, A and B subunits  59.13 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4878  20S proteasome A and B subunits  58.12 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1789  putative 20S proteasome alpha-subunit  55.13 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4460  20S proteasome A and B subunits  56.05 
 
 		 265 aa  265  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190123  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2464  20S proteasome A and B subunits  58.82 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2160  20S proteasome A and B subunits  59.43 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2683  20S proteasome A and B subunits  58.33 
 
 		 287 aa  260  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2646  20S proteasome, A and B subunits  57.2 
 
 		 255 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.786174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2626  20S proteasome, A and B subunits  56.17 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1496  20S proteasome A and B subunits  53.19 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1874  20S proteasome A and B subunits  55.74 
 
 		 237 aa  244  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1489  20S proteasome A and B subunits  54.94 
 
 		 244 aa  242  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2312  20S proteasome A and B subunits  52.99 
 
 		 228 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2968  20S proteasome A and B subunits  54.55 
 
 		 269 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000852426  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1189  20S proteasome, A and B subunits  56.78 
 
 		 234 aa  235  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.431495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20860  20S proteasome subunit (alpha or beta)  52.99 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2177  20S proteasome, A and B subunits  48.12 
 
 		 235 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1831  20S proteasome subunits AB  49.8 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1920  20S proteasome A and B subunits  50 
 
 		 236 aa  226  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5870  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  52.97 
 
 		 257 aa  221  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2427  20S proteasome A and B subunits  52.12 
 
 		 292 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0676783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2000  20S proteasome A and B subunits  54.27 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.184278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0911  20S proteasome A and B subunits  44.73 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0394766  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1205  20S proteasome A and B subunits  51.6 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  56.69 
 
 		 690 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  28.37 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  27.6 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  23.73 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  27.22 
 
 		 196 aa  42.4  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>