107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2237 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2648  hypothetical protein  68.74 
 
 
453 aa  642    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.43025  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1875  protein of unknown function DUF245 domain protein  69.62 
 
 
453 aa  657    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.94566  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2237  protein of unknown function DUF245 domain protein  100 
 
 
690 aa  1387    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.195166  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2428  protein of unknown function DUF245 domain protein  67.41 
 
 
453 aa  644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0805092  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20850  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  71.05 
 
 
455 aa  671    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.990825  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1490  protein of unknown function DUF245 domain protein  74.29 
 
 
457 aa  691    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1999  protein of unknown function DUF245 domain protein  76.5 
 
 
453 aa  709    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1191  hypothetical protein  67.48 
 
 
452 aa  634  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0459956  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5868  hypothetical protein  67.11 
 
 
452 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.459714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1829  hypothetical protein  66.89 
 
 
452 aa  627  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2684  protein of unknown function DUF245 domain protein  67.63 
 
 
452 aa  627  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2247  hypothetical protein  66.81 
 
 
452 aa  618  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2364  hypothetical protein  66.81 
 
 
452 aa  619  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260978  normal  0.137924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2313  protein of unknown function DUF245 domain protein  67.26 
 
 
452 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000209819  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4459  hypothetical protein  66 
 
 
452 aa  615  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.137824  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1788  hypothetical protein  65.78 
 
 
452 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00862097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2247  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.52 
 
 
452 aa  611  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889269  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2612  hypothetical protein  65.27 
 
 
454 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000110138  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1497  protein of unknown function DUF245 domain protein  65.78 
 
 
452 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4874  hypothetical protein  65.56 
 
 
452 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1206  protein of unknown function DUF245 domain protein  66.37 
 
 
459 aa  607  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.289494  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21990  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  65.19 
 
 
452 aa  604  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0167932  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3445  hypothetical protein  63.26 
 
 
462 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318855  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3089  hypothetical protein  64.08 
 
 
452 aa  595  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221637  normal  0.342972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12132  hypothetical protein  64.75 
 
 
452 aa  598  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.73794e-22  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1921  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.75 
 
 
454 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2467  protein of unknown function DUF245-like protein  63.86 
 
 
452 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2178  hypothetical protein  62.08 
 
 
454 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0250517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2512  hypothetical protein  63.76 
 
 
447 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288414  normal  0.244225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2504  hypothetical protein  63.76 
 
 
447 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2166  protein of unknown function DUF245 domain protein  64.21 
 
 
447 aa  585  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.416348  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2960  protein of unknown function DUF245 domain protein  63.64 
 
 
452 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000286754  hitchhiker  0.00476046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2465  protein of unknown function DUF245 domain protein  62.86 
 
 
447 aa  568  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0367879  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0912  protein of unknown function DUF245 domain protein  58.22 
 
 
455 aa  529  1e-149  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0181163  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11920  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  51.86 
 
 
464 aa  433  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.202795  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16170  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  51.84 
 
 
473 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0613533  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1975  putative proteasome component  43.93 
 
 
486 aa  323  9.000000000000001e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5889  hypothetical protein  45.88 
 
 
504 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0952006  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1796  putative proteasome component  40.86 
 
 
511 aa  282  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317252  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1836  hypothetical protein  45.14 
 
 
505 aa  279  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3131  protein of unknown function DUF245-like protein  40.44 
 
 
517 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313947  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3193  hypothetical protein  40.44 
 
 
517 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3143  hypothetical protein  40.44 
 
 
517 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.551994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2308  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.06 
 
 
505 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000844053  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4881  hypothetical protein  39.71 
 
 
574 aa  273  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352263  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22050  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  39.13 
 
 
500 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00878282  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2239  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.49 
 
 
499 aa  270  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1489  20S proteasome A and B subunits  82.58 
 
 
244 aa  270  8e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12144  hypothetical protein  39.33 
 
 
611 aa  269  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20860  20S proteasome subunit (alpha or beta)  70.15 
 
 
255 aa  269  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3451  hypothetical protein  39.33 
 
 
502 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304469  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1186  hypothetical protein  42.86 
 
 
503 aa  266  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.418089  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3075  hypothetical protein  39.33 
 
 
521 aa  266  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1488  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.04 
 
 
505 aa  265  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283032  normal  0.138828 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2629  hypothetical protein  36.44 
 
 
505 aa  264  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.180519 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2679  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.82 
 
 
501 aa  263  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2242  hypothetical protein  44.41 
 
 
505 aa  261  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.837197  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4463  hypothetical protein  43.6 
 
 
506 aa  260  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2155  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.97 
 
 
497 aa  259  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2643  hypothetical protein  41.79 
 
 
502 aa  257  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0762844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2424  protein of unknown function DUF245 domain protein  41.53 
 
 
503 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268594  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2461  protein of unknown function DUF245 domain protein  39.23 
 
 
499 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1874  20S proteasome A and B subunits  76.77 
 
 
237 aa  254  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2359  hypothetical protein  43.87 
 
 
499 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2000  20S proteasome A and B subunits  70.3 
 
 
244 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.184278  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0908  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.83 
 
 
497 aa  251  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16190  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  41.9 
 
 
562 aa  245  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1205  20S proteasome A and B subunits  74.19 
 
 
236 aa  244  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114404  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2971  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.78 
 
 
503 aa  244  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0494873  normal  0.0174629 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2003  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.97 
 
 
535 aa  240  6.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.42457  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1871  protein of unknown function DUF245 domain protein  40.1 
 
 
541 aa  239  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2312  20S proteasome A and B subunits  73.2 
 
 
228 aa  236  9e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1789  putative 20S proteasome alpha-subunit  55.07 
 
 
249 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1920  20S proteasome A and B subunits  69.68 
 
 
236 aa  233  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2177  20S proteasome, A and B subunits  69.03 
 
 
235 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0017271  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2240  protein of unknown function DUF245 domain protein  37.68 
 
 
534 aa  232  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.329209  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2646  20S proteasome, A and B subunits  71.79 
 
 
255 aa  231  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.786174  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11870  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  41.24 
 
 
575 aa  230  8e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493273  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1189  20S proteasome, A and B subunits  61.42 
 
 
234 aa  228  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.431495  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2683  20S proteasome A and B subunits  66.25 
 
 
287 aa  224  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1202  protein of unknown function DUF245 domain protein  36.63 
 
 
543 aa  224  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0256776  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5870  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  67.92 
 
 
257 aa  223  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1831  20S proteasome subunits AB  67.31 
 
 
276 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2242  20S proteasome A and B subunits  67.74 
 
 
263 aa  221  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2174  hypothetical protein  38.27 
 
 
536 aa  217  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0914455  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2626  20S proteasome, A and B subunits  68.18 
 
 
238 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1917  protein of unknown function DUF245 domain protein  38.54 
 
 
539 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000029897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2362  20S proteasome A and B subunits  63.75 
 
 
273 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.674548  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20890  putative proteasome component/protein of unknown function, DUF275  35.08 
 
 
529 aa  213  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2245  20S proteasome, A and B subunits  63.12 
 
 
260 aa  213  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.916002  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2968  20S proteasome A and B subunits  55.96 
 
 
269 aa  213  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000852426  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4460  20S proteasome A and B subunits  63.23 
 
 
265 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190123  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1496  20S proteasome A and B subunits  63.4 
 
 
251 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1486  protein of unknown function DUF245 domain protein  35.35 
 
 
545 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4878  20S proteasome A and B subunits  65.58 
 
 
239 aa  209  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0911  20S proteasome A and B subunits  60.57 
 
 
232 aa  209  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0394766  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22020  20S proteasome subunit (alpha or beta)  64.1 
 
 
255 aa  207  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0199133  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3448  20S proteasome, A and B subunits  58.6 
 
 
254 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.283261  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2464  20S proteasome A and B subunits  61.15 
 
 
262 aa  197  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3078  20S proteasome, A and B subunits  57.96 
 
 
251 aa  196  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.136631 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>