152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0694 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  45.6 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  42.49 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  39.69 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  41.84 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  42.19 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  41.71 
 
 		 211 aa  150  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  39.89 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  41.45 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  40.93 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  40.41 
 
 		 203 aa  148  5e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  39.46 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  41.84 
 
 		 210 aa  147  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  37.63 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  38.17 
 
 		 196 aa  144  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  41.84 
 
 		 207 aa  143  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  38.14 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  37.57 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  35.71 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  35.71 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  35.38 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  35.2 
 
 		 217 aa  134  9e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  34.69 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  35.64 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  36.46 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  37.16 
 
 		 200 aa  122  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  37.63 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  37.02 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  36.08 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  31.28 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  35.63 
 
 		 206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  34.76 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  31.89 
 
 		 282 aa  110  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  32.8 
 
 		 243 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  29.81 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  30.73 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  27.14 
 
 		 296 aa  101  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  29.63 
 
 		 297 aa  99.4  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  33.7 
 
 		 272 aa  95.9  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  28.88 
 
 		 301 aa  95.5  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  32.46 
 
 		 250 aa  94.7  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  34.64 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  30.16 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  30.35 
 
 		 303 aa  87.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  31.84 
 
 		 243 aa  87  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  27.86 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  30.22 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  24.62 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.84 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.05 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14571  predicted protein  28.42 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  25 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  24.14 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  24.61 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  27.92 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  25.68 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  25.36 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  25 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  26.56 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  25.53 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  24.38 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  25.81 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  29.14 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  25.13 
 
 		 271 aa  67  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  26.6 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  28.41 
 
 		 249 aa  64.7  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  24.56 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  28.35 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  26.59 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  28.29 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  26.04 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10708  hypothetical proteasome beta 7 subunit (Eurofung)  24.12 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  26.56 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  24.26 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31764  predicted protein  21.24 
 
 		 289 aa  62  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0071372 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02950  endopeptidase, putative  25.37 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0631891  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  24.72 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  26.09 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  27.95 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.17 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12731  predicted protein  21.97 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  26.04 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  27.84 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  26.63 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  28.65 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  28.19 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  27.33 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  24.75 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  27.98 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  27.33 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  28.09 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  26.63 
 
 		 273 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  27.57 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  27.16 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  24.14 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04457  20S proteasome beta-type subunit (Eurofung)  25.79 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0477671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14449  predicted protein  27.12 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0963899  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  21.93 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  24.71 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  25.12 
 
 		 284 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>