53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02950 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK02950  endopeptidase, putative  100 
 
 
280 aa  580  1.0000000000000001e-165  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0631891  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10708  hypothetical proteasome beta 7 subunit (Eurofung)  45.49 
 
 
260 aa  232  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89662  B-type subunit of proteasome  42.71 
 
 
281 aa  225  6e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.596472 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31764  predicted protein  33.19 
 
 
289 aa  160  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0071372 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  28.1 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  28.51 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  25.35 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  25.82 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  25.82 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  27.94 
 
 
217 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  25.35 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  26.07 
 
 
214 aa  63.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  25.35 
 
 
219 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  25.37 
 
 
198 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  26.87 
 
 
211 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  30.05 
 
 
197 aa  59.3  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  27.54 
 
 
209 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  25.12 
 
 
213 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.27 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  28.92 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  27.01 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  26.37 
 
 
207 aa  52.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  29.03 
 
 
203 aa  52.8  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  24.88 
 
 
301 aa  52.4  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  27.94 
 
 
203 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  24.04 
 
 
227 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  28.93 
 
 
204 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55763  predicted protein  23.04 
 
 
194 aa  50.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  26.47 
 
 
203 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.64 
 
 
237 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  26.11 
 
 
203 aa  48.9  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.12 
 
 
196 aa  48.9  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  22.86 
 
 
217 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  26.09 
 
 
200 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.45 
 
 
243 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  23.18 
 
 
272 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.22 
 
 
243 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  29.76 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 
196 aa  46.6  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04990  proteasome subunit beta type 2, putative  25.97 
 
 
224 aa  46.2  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.846923  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  22.77 
 
 
225 aa  45.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  25.49 
 
 
210 aa  46.2  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  25 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  24.07 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  33.33 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  19.72 
 
 
232 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  23.67 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  23.03 
 
 
245 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  26.63 
 
 
202 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  19.07 
 
 
199 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  24.56 
 
 
249 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04457  20S proteasome beta-type subunit (Eurofung)  22.55 
 
 
203 aa  42.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0477671  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  24 
 
 
251 aa  42.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>