45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12731 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12731  predicted protein  100 
 
 		 227 aa  461  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  34.36 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  36.28 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  31.28 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  31.28 
 
 		 192 aa  125  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  31.76 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  26.43 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  26.43 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  26.43 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  26.01 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  24.77 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  26.05 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  29.74 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  24.65 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  30.29 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  23.83 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  27.16 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  21.97 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  26.51 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  21.97 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.47 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  23.36 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  24.75 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  27.19 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  24.66 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  26.54 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  23.36 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  22.43 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  25.35 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  26.62 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  25.76 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.07 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.87 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  30.49 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  29.07 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  21.57 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  21.86 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04457  20S proteasome beta-type subunit (Eurofung)  23.5 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0477671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  25.23 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  23.26 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  25.43 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.26 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  29.07 
 
 		 296 aa  41.6  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  24 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>