71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0723 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 
233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  37.88 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  31.34 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  32.47 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  31.96 
 
 
259 aa  85.9  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  31.96 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  34.2 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  32.46 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  29.89 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  29.35 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  31.05 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  30.77 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  29.44 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  29.59 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  31.25 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  28.24 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.57 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  32.47 
 
 
241 aa  72  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.04 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  27.46 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  28.12 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  29.56 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  27.75 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  30.89 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  28.36 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  29.15 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  29.53 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  31.44 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  27.52 
 
 
270 aa  68.6  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  31.44 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  28.28 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  28.71 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  29.47 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  30.21 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  28.72 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  27.41 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  29.73 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  26.98 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  29.59 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  27.89 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  27.75 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  25.89 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  27.27 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  29.48 
 
 
180 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  25.7 
 
 
233 aa  58.5  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  28.42 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  27.23 
 
 
245 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  26.99 
 
 
280 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  26.29 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 
256 aa  56.6  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  27.27 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  28.26 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  24.76 
 
 
246 aa  52  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  24.88 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  27.69 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  23.47 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  25.53 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  25.93 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  26.51 
 
 
198 aa  50.1  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  28.4 
 
 
256 aa  48.9  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  30.65 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  28.66 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  40.58 
 
 
203 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  29.84 
 
 
203 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  35.16 
 
 
203 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  26.25 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  24.86 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  31.97 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  26.18 
 
 
250 aa  43.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  23.96 
 
 
299 aa  43.5  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  24.87 
 
 
299 aa  42.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>