95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01860 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  100 
 
 
285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  57.89 
 
 
255 aa  315  5e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  55.93 
 
 
253 aa  308  8e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  52.1 
 
 
231 aa  250  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  47.62 
 
 
264 aa  241  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  40.35 
 
 
243 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  39.76 
 
 
238 aa  175  6e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  39.47 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  39.04 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  38.6 
 
 
259 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  38.6 
 
 
241 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  38.6 
 
 
259 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  37.89 
 
 
242 aa  168  7e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  37.72 
 
 
251 aa  167  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  40 
 
 
245 aa  163  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  37.61 
 
 
241 aa  162  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  36.61 
 
 
271 aa  161  9e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  40.67 
 
 
241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  34.4 
 
 
263 aa  155  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  32.81 
 
 
249 aa  155  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  34.23 
 
 
240 aa  155  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  40.58 
 
 
243 aa  155  7e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  38.97 
 
 
240 aa  154  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  34.9 
 
 
248 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  33.7 
 
 
257 aa  152  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  34.58 
 
 
239 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  38.76 
 
 
240 aa  148  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  32.62 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  35.46 
 
 
240 aa  146  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  34.33 
 
 
250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  36.55 
 
 
270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  34.62 
 
 
246 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  34.98 
 
 
249 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  36.05 
 
 
271 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  32.68 
 
 
237 aa  143  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  38.68 
 
 
272 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  35.98 
 
 
258 aa  142  8e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  34.92 
 
 
251 aa  142  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  33.2 
 
 
235 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  33.21 
 
 
247 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  36.17 
 
 
250 aa  139  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  35.02 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  35.59 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  34.18 
 
 
252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  38.27 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  33.03 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  33.64 
 
 
250 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  35.82 
 
 
240 aa  129  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  34.68 
 
 
278 aa  129  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  36.54 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  35.23 
 
 
233 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  31.03 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  32.58 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  31.38 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  30 
 
 
246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  34.63 
 
 
247 aa  112  9e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  31.51 
 
 
299 aa  109  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  28.79 
 
 
246 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  29.79 
 
 
250 aa  105  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  28.57 
 
 
236 aa  102  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  28.79 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  32.16 
 
 
269 aa  99.4  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  30.53 
 
 
256 aa  99.4  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  31.82 
 
 
245 aa  99  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  32.16 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  26.74 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  26.67 
 
 
299 aa  88.2  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  27.95 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  28.57 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  24.74 
 
 
180 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  23.21 
 
 
217 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  25.87 
 
 
200 aa  58.9  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  23.19 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  24.63 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  25.12 
 
 
200 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  24.24 
 
 
203 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0723  20S proteasome A and B subunits  26.29 
 
 
233 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0105986  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  23.74 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  23.44 
 
 
203 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  23.15 
 
 
201 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  23.7 
 
 
210 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  20.52 
 
 
219 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  21.18 
 
 
202 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  25 
 
 
204 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  22.86 
 
 
246 aa  47  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.68 
 
 
210 aa  47  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  22.16 
 
 
225 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  22.22 
 
 
207 aa  46.2  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  20.09 
 
 
219 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  20.09 
 
 
219 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  22.34 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  23.44 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  24.68 
 
 
196 aa  43.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  21.7 
 
 
210 aa  42.7  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>