97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4879 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 		 274 aa  551  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  86.03 
 
 		 304 aa  473  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  64.94 
 
 		 284 aa  348  8e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  61.09 
 
 		 283 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  62.22 
 
 		 288 aa  336  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  61.54 
 
 		 324 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  62.08 
 
 		 276 aa  329  3e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  59.27 
 
 		 290 aa  328  8e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  56.36 
 
 		 302 aa  325  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  62.04 
 
 		 279 aa  322  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  60.08 
 
 		 285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  57.46 
 
 		 282 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  58.58 
 
 		 280 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  57.56 
 
 		 279 aa  311  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  56.67 
 
 		 282 aa  306  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  54.41 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  58.4 
 
 		 278 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  55.04 
 
 		 273 aa  285  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  58.39 
 
 		 288 aa  285  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2682  20S proteasome A and B subunits  59.85 
 
 		 280 aa  284  9e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479175  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  55.51 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  56.32 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22030  proteasome endopeptidase complex, beta component  52.73 
 
 		 289 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00409578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  55.86 
 
 		 275 aa  272  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  52.65 
 
 		 292 aa  271  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  52.16 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  54.31 
 
 		 280 aa  265  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  50.97 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  52.34 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  52.34 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  52.34 
 
 		 304 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1015  20S proteasome, A and B subunits  51.97 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.410005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  48.85 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  52.49 
 
 		 273 aa  238  8e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  50.78 
 
 		 306 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12142  proteasome beta subunit prcB  50.19 
 
 		 291 aa  229  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000259602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  34.64 
 
 		 214 aa  92  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  28.37 
 
 		 211 aa  89  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  31.28 
 
 		 209 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  30.45 
 
 		 207 aa  85.5  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  28.44 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  28.44 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  28.99 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  27.52 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  27.56 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  32.51 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  29.7 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  27.06 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  31.46 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  26.4 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  29.41 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  28.57 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  27.41 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  30.22 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  30.81 
 
 		 197 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  29.41 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  26.26 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  31.61 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  25.94 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.79 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.98 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  26.94 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  25.87 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  29.95 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  28.33 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.49 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  25.25 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  28.8 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  26.14 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  24.79 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  26.04 
 
 		 199 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  24.38 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  23.88 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  24.58 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.19 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28.06 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  30.11 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  23.98 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  28.81 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  24.63 
 
 		 204 aa  50.4  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  25.68 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  26.4 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  25.42 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2740  ATP-dependent protease peptidase subunit  29.83 
 
 		 176 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  25.24 
 
 		 198 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  28.67 
 
 		 227 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  36.62 
 
 		 181 aa  45.8  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  26.43 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  28.06 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  25.74 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  26.46 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  29.33 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  22.77 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  26.11 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  25.99 
 
 		 259 aa  42  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>