143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2463 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 		 292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  61.48 
 
 		 304 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  61.48 
 
 		 304 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  61.48 
 
 		 304 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  60.82 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  59.77 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  60 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12142  proteasome beta subunit prcB  62.93 
 
 		 291 aa  305  7e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000259602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22030  proteasome endopeptidase complex, beta component  57.25 
 
 		 289 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00409578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  57.74 
 
 		 290 aa  301  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  58.17 
 
 		 273 aa  291  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  54.2 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1015  20S proteasome, A and B subunits  57.35 
 
 		 282 aa  288  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.410005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  57.81 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  55.47 
 
 		 284 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  55.72 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  55.72 
 
 		 280 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  55.79 
 
 		 276 aa  280  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  54.45 
 
 		 282 aa  278  9e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  56.25 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  54.47 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  56.62 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  55.17 
 
 		 285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  52.65 
 
 		 274 aa  271  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  53.82 
 
 		 279 aa  271  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2682  20S proteasome A and B subunits  58.56 
 
 		 280 aa  265  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479175  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  50.56 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  51.33 
 
 		 282 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  54.58 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  58.09 
 
 		 288 aa  258  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  54.05 
 
 		 275 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  49.64 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  53.96 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  52.77 
 
 		 273 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  50.39 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  51.53 
 
 		 280 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  32.88 
 
 		 211 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  32.43 
 
 		 219 aa  94.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  32.88 
 
 		 219 aa  92.4  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  32.88 
 
 		 219 aa  92.4  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  35.57 
 
 		 212 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  32.88 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  32.24 
 
 		 217 aa  87.8  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  33.33 
 
 		 210 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  36.13 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  33.69 
 
 		 209 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  36.27 
 
 		 200 aa  81.6  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  33.15 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  33.16 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  37.93 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  31.12 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  33.88 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  29.26 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  29.73 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  31.79 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  28.34 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  27.86 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  28.86 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  28.11 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  27.01 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  29.48 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.75 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.01 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.72 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  31.19 
 
 		 181 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  27.62 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  29.02 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  23 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  29.35 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  27.01 
 
 		 199 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  27.66 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  27.66 
 
 		 201 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  30.81 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.37 
 
 		 196 aa  50.1  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  25.95 
 
 		 187 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  33.15 
 
 		 181 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000068782  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  28.44 
 
 		 203 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  29.12 
 
 		 179 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  26.6 
 
 		 201 aa  49.3  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  29.52 
 
 		 179 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  27.59 
 
 		 204 aa  48.9  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  26.32 
 
 		 200 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  24.88 
 
 		 237 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  23.53 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  26.59 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  25.63 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  27.27 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  28.44 
 
 		 203 aa  47.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.26 
 
 		 187 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.06 
 
 		 180 aa  46.6  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  26.96 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  31.79 
 
 		 184 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  27.23 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  26.54 
 
 		 180 aa  45.8  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.48223 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  39.71 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  39.71 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  39.71 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  39.71 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  39.71 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  39.71 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>