More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2129 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2129  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
645 aa  1304    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
634 aa  174  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2335  histidine kinase  32.27 
 
 
610 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249479  normal  0.165398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
631 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 
662 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0340  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 
816 aa  163  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1150  signal transduction histidine kinase-like protein  29.17 
 
 
609 aa  158  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
653 aa  158  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2456  composite two-component regulatory (sensor kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  30.32 
 
 
638 aa  156  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  31.54 
 
 
606 aa  154  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 
675 aa  152  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 
1172 aa  151  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
1177 aa  150  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2688  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
589 aa  150  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4849  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
655 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0479308  normal  0.0448623 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.71 
 
 
1445 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1172 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
817 aa  147  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  31.93 
 
 
593 aa  147  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1814  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
662 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0106  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
657 aa  147  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816197  normal  0.0449615 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4855  putative two-component hybrid histidine kinase, periplasmic sensor  31.52 
 
 
591 aa  145  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268249  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2627  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
1116 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.594612  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3756  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
672 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.866154  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  30.34 
 
 
1169 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 
655 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5115  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
609 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0345398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 
635 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2881  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 
632 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.365727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1575  histidine kinase  34.28 
 
 
777 aa  140  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.179984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
556 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  33.53 
 
 
1169 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  26.71 
 
 
1148 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 
1167 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 
567 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 
645 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 
1169 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3590  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
594 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2743  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.48 
 
 
611 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
554 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6380  putative two-component sensor histidine kinase  29.38 
 
 
596 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
621 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  29.06 
 
 
1147 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
561 aa  136  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  30.55 
 
 
1177 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
1168 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  29.05 
 
 
1150 aa  135  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
1159 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  28.57 
 
 
881 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1300  histidine kinase  31.65 
 
 
468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0380592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
1174 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2698  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 
595 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.155122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  32.23 
 
 
454 aa  133  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  32.49 
 
 
447 aa  133  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
1138 aa  133  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
574 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1817  histidine kinase  33.5 
 
 
454 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
1159 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
1159 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
1158 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  30.77 
 
 
697 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0510  histidine kinase  28.57 
 
 
629 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
1168 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
1163 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  29.97 
 
 
1055 aa  132  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
1170 aa  131  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  29.3 
 
 
604 aa  131  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 
571 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1450  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
548 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000168793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 
1169 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.61 
 
 
1158 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4361  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 
625 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  32.46 
 
 
1174 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  27.54 
 
 
868 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  27.04 
 
 
1157 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  28.4 
 
 
1159 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2352  histidine kinase  31.46 
 
 
441 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 
1152 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 
1169 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.94 
 
 
1166 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 
1171 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
1169 aa  125  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
744 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  27.92 
 
 
1159 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5189  Signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
539 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  24.78 
 
 
1156 aa  124  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3253  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
545 aa  124  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  25.6 
 
 
842 aa  124  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  31.5 
 
 
448 aa  124  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0508  histidine kinase  30.14 
 
 
663 aa  124  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.217821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 
1316 aa  123  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02256  Multidomain protein, contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  28.9 
 
 
1006 aa  123  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.371064  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
1145 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 
1146 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  31.2 
 
 
577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  29.43 
 
 
1146 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3951  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252359  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  28.93 
 
 
666 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46370  putative two-component sensor  31.86 
 
 
540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304755  hitchhiker  0.00684988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  29.53 
 
 
1161 aa  121  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>