253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3826 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3826  putative diguanylate cyclase  100 
 
 
217 aa  440  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0556078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4102  hypothetical protein  84.33 
 
 
217 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1137  hypothetical protein  83.41 
 
 
217 aa  374  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00579887  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4120  hypothetical protein  83.1 
 
 
213 aa  364  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000136975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4048  hypothetical protein  83.02 
 
 
213 aa  362  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000128162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4015  hypothetical protein  82.16 
 
 
213 aa  361  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3755  hypothetical protein  82.08 
 
 
213 aa  361  6e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0428114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3739  hypothetical protein  82.08 
 
 
213 aa  359  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114399  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3907  hypothetical protein  80.75 
 
 
206 aa  348  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00587396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4213  hypothetical protein  80.75 
 
 
206 aa  348  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000232532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2700  diguanylate cyclase  60.83 
 
 
218 aa  276  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000527165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1779  diguanylate cyclase  24.16 
 
 
215 aa  62  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.86 
 
 
781 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.015368  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1170  hypothetical protein  25.9 
 
 
768 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1176  hypothetical protein  25.9 
 
 
768 aa  58.2  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0796  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.89 
 
 
765 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.341606 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  27.69 
 
 
718 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.23 
 
 
1125 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  23.97 
 
 
627 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3234  diguanylate cyclase  24.32 
 
 
295 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.65 
 
 
585 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1078  diguanylate cyclase  22.97 
 
 
283 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.239628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.91 
 
 
557 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3734  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.22 
 
 
582 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.598305  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2151  diguanylate cyclase  26.72 
 
 
275 aa  52.8  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3290  diguanylate cyclase  27.48 
 
 
473 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1034  diguanylate cyclase  21.48 
 
 
283 aa  52  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2449  GGDEF domain-containing protein  26.12 
 
 
498 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  22.6 
 
 
1644 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0590  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.97 
 
 
1144 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.851066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  23.2 
 
 
1826 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0540  diguanylate cyclase  25.76 
 
 
489 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0649  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.62 
 
 
742 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.35 
 
 
1094 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1333  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.45 
 
 
575 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76071  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  23.29 
 
 
1346 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  24.11 
 
 
414 aa  49.7  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2237  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.45 
 
 
556 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  23.08 
 
 
517 aa  49.7  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.6 
 
 
577 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  21.92 
 
 
638 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3475  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  21.38 
 
 
571 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0662  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.62 
 
 
742 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.47145e-25 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2006  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.08 
 
 
724 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332381  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0677  sensory box/GGDEF family protein  21.77 
 
 
947 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000825914  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.32 
 
 
550 aa  48.9  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0234  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.67 
 
 
540 aa  49.3  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1557  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.14 
 
 
292 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.24573  hitchhiker  0.000000000880766 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20 
 
 
1466 aa  48.9  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.13 
 
 
577 aa  48.9  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2016  sensory box/GGDEF family protein  23.45 
 
 
799 aa  48.5  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4552  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.92 
 
 
624 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1859  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.31 
 
 
917 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3494  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.69 
 
 
729 aa  48.5  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  19.73 
 
 
965 aa  48.5  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.928447  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25 
 
 
574 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0502  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.49 
 
 
705 aa  48.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1982  diguanylate cyclase  28.57 
 
 
335 aa  47.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4948  sensory box protein  25.34 
 
 
921 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0674  diguanylate cyclase  24.07 
 
 
355 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4217  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.48 
 
 
916 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3085  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.7 
 
 
905 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  23.94 
 
 
611 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4327  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.48 
 
 
916 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0127578 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  24.83 
 
 
439 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0574  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.55 
 
 
772 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122166  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3124  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  18.75 
 
 
609 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3547  diguanylate cyclase  23.29 
 
 
314 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928319  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2370  diguanylate cyclase  22.38 
 
 
554 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.76 
 
 
1264 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_003296  RS05432  hypothetical protein  23.24 
 
 
915 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2041  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  22.6 
 
 
317 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  23.01 
 
 
593 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  21.12 
 
 
356 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.78 
 
 
837 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  22.82 
 
 
1099 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0458  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.62 
 
 
1037 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2332  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with FHA and GAF sensor  20.55 
 
 
884 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0892  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.32 
 
 
693 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.914859  decreased coverage  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2067  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  22.6 
 
 
317 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0606  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  21.77 
 
 
622 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0540  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.38 
 
 
693 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344022 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0689  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.07 
 
 
723 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.452404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  19.31 
 
 
513 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2113  extracellular solute-binding protein  22 
 
 
955 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1202  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.34 
 
 
692 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4402  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.29 
 
 
563 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  21.13 
 
 
808 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  28.18 
 
 
427 aa  46.6  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  25.35 
 
 
339 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0598  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  21.77 
 
 
622 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1060  diguanylate cyclase  23.39 
 
 
378 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0114541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2850  diguanylate cyclase  24.58 
 
 
135 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000925897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3958  diguanylate cyclase  20.69 
 
 
349 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131917  normal  0.325854 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1808  diguanylate cyclase  17.99 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148862  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4032  diguanylate cyclase  24.29 
 
 
561 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.211058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3093  diguanylate cyclase  26.19 
 
 
387 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2477  hypothetical protein  21.09 
 
 
273 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2465  diguanylate cyclase  24.8 
 
 
427 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0457  diguanylate cyclase  24.31 
 
 
472 aa  45.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.562676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>