90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_4213 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007530  GBAA_4213  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000232532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3907  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00587396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4015  hypothetical protein  95.31 
 
 
213 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3739  hypothetical protein  95.28 
 
 
213 aa  407  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114399  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3755  hypothetical protein  91.98 
 
 
213 aa  394  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0428114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4120  hypothetical protein  91.55 
 
 
213 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000136975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4048  hypothetical protein  90.57 
 
 
213 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000128162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4102  hypothetical protein  85.45 
 
 
217 aa  368  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1137  hypothetical protein  83.57 
 
 
217 aa  360  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00579887  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3826  putative diguanylate cyclase  80.75 
 
 
217 aa  348  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0556078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2700  diguanylate cyclase  61.5 
 
 
218 aa  270  7e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000527165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3092  diguanylate cyclase  23.85 
 
 
389 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1779  diguanylate cyclase  26.24 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1170  hypothetical protein  20.53 
 
 
768 aa  51.6  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1176  hypothetical protein  20.53 
 
 
768 aa  51.6  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0796  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.52 
 
 
765 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.341606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20.61 
 
 
577 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1933  sensory box protein  21.99 
 
 
692 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0364295  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  21.19 
 
 
781 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.015368  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0590  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.29 
 
 
1144 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.851066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.27 
 
 
557 aa  49.7  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2151  diguanylate cyclase  26.67 
 
 
275 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1161  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.32 
 
 
754 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268415  normal  0.0126902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3290  diguanylate cyclase  25 
 
 
473 aa  48.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21190  hypothetical protein  24.29 
 
 
785 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.42827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4948  sensory box protein  26.03 
 
 
921 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.69 
 
 
577 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3334  diguanylate cyclase  20.65 
 
 
321 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25 
 
 
473 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  19.73 
 
 
965 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.928447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0540  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.6 
 
 
693 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1808  hypothetical protein  26.81 
 
 
726 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3124  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.87 
 
 
609 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2006  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.08 
 
 
724 aa  45.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332381  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  26.92 
 
 
718 aa  45.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  23.29 
 
 
1099 aa  45.4  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  19.18 
 
 
1644 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  23.08 
 
 
417 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2041  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  20.55 
 
 
317 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2067  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  20.55 
 
 
317 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2332  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with FHA and GAF sensor  23.62 
 
 
884 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3052  GGDEF  21.09 
 
 
523 aa  45.1  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.927179  normal  0.0159246 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  19.31 
 
 
1466 aa  45.1  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3448  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.09 
 
 
696 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1988  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  18.75 
 
 
435 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  24.06 
 
 
1346 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2656  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.09 
 
 
696 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3547  diguanylate cyclase  20.55 
 
 
314 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928319  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1982  diguanylate cyclase  26.05 
 
 
335 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  22.76 
 
 
1826 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  20.86 
 
 
808 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3093  diguanylate cyclase  33.71 
 
 
387 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1178  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.83 
 
 
754 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.578414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0677  sensory box/GGDEF family protein  20.12 
 
 
947 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000825914  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  23.81 
 
 
550 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  18.57 
 
 
1079 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2937  signal transduction protein  20.41 
 
 
1141 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0884  diguanylate cyclase  21.57 
 
 
285 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.576242  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.36 
 
 
1264 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1886  diguanylate cyclase  25.78 
 
 
462 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3194  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.64 
 
 
726 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.178802  normal  0.0329837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4273  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.22 
 
 
754 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2850  diguanylate cyclase  25.81 
 
 
135 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000925897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2465  diguanylate cyclase  20.59 
 
 
427 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1144  GGDEF domain-containing protein  22.22 
 
 
754 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2173  hypothetical protein, GGDEF domain  23.6 
 
 
377 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.17 
 
 
585 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1635  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.08 
 
 
643 aa  42.7  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1569  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.08 
 
 
643 aa  42.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  18.47 
 
 
1125 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5652  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.27 
 
 
1061 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3734  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.88 
 
 
582 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.598305  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1557  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  20.55 
 
 
292 aa  42.4  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.24573  hitchhiker  0.000000000880766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3329  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.73 
 
 
684 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2066  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.2 
 
 
584 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.684851  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.26 
 
 
1094 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1557  diguanylate cyclase with GAF sensor  21.31 
 
 
741 aa  42  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814898 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  20.83 
 
 
608 aa  42  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  29.35 
 
 
457 aa  42  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1835  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  19.16 
 
 
654 aa  42  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0773497  normal  0.315507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.72 
 
 
322 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3597  diguanylate cyclase  22.86 
 
 
385 aa  42  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2580  GGDEF domain-containing protein  21.52 
 
 
1774 aa  42  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1658  response regulator/GGDEF domain-containing protein  26.74 
 
 
458 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.939598  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2370  diguanylate cyclase  28.57 
 
 
554 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1680  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  19.18 
 
 
1524 aa  41.6  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.482461  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2984  GGDEF domain-containing protein  20.59 
 
 
483 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.301535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1425  diguanylate cyclase  18.32 
 
 
424 aa  41.6  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5454  RNase II stability modulator  24.72 
 
 
689 aa  41.2  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  31.91 
 
 
712 aa  41.2  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>