205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4048 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4048  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  431  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000128162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4120  hypothetical protein  99.06 
 
 
213 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000136975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3755  hypothetical protein  96.71 
 
 
213 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0428114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3739  hypothetical protein  94.84 
 
 
213 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4015  hypothetical protein  94.81 
 
 
213 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3907  hypothetical protein  90.57 
 
 
206 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00587396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4213  hypothetical protein  90.57 
 
 
206 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000232532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4102  hypothetical protein  90.57 
 
 
217 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1137  hypothetical protein  89.62 
 
 
217 aa  387  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00579887  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3826  putative diguanylate cyclase  83.02 
 
 
217 aa  362  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0556078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2700  diguanylate cyclase  61.32 
 
 
218 aa  275  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000527165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3092  diguanylate cyclase  24.2 
 
 
389 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1779  diguanylate cyclase  24.11 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1170  hypothetical protein  22.64 
 
 
768 aa  58.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1176  hypothetical protein  22.64 
 
 
768 aa  58.9  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.75 
 
 
577 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4948  sensory box protein  26.71 
 
 
921 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1161  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.21 
 
 
754 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268415  normal  0.0126902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  19.46 
 
 
965 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.928447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3290  diguanylate cyclase  25.56 
 
 
473 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  20.13 
 
 
781 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.015368  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0796  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  21.48 
 
 
765 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.341606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.5 
 
 
473 aa  52.4  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  22.07 
 
 
1826 aa  52  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.09 
 
 
1264 aa  51.6  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  18.4 
 
 
1644 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3093  diguanylate cyclase  24.85 
 
 
387 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0502  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.07 
 
 
705 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  22.54 
 
 
627 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3334  diguanylate cyclase  20.65 
 
 
321 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798372  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4217  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  21.82 
 
 
916 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.61 
 
 
557 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4327  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  21.82 
 
 
916 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0127578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1680  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  19.86 
 
 
1524 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.482461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0590  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.29 
 
 
1144 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.851066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3734  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.48 
 
 
582 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.598305  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2465  diguanylate cyclase  25.58 
 
 
427 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0337  EAL/GGDEF domain-containing protein  24.52 
 
 
490 aa  48.9  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.622356  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3727  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.46 
 
 
748 aa  49.3  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2656  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.36 
 
 
696 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3448  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.36 
 
 
696 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1557  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  21.09 
 
 
292 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.24573  hitchhiker  0.000000000880766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21190  hypothetical protein  25.21 
 
 
785 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.42827 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2006  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.08 
 
 
724 aa  48.9  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.332381  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  19.31 
 
 
1466 aa  48.5  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  21.92 
 
 
1099 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  20.55 
 
 
1346 aa  48.5  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  24.31 
 
 
614 aa  48.5  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1988  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  18.89 
 
 
435 aa  48.5  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2850  diguanylate cyclase  23.33 
 
 
135 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000925897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1202  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.43 
 
 
692 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2066  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.99 
 
 
584 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.684851  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  18.46 
 
 
1079 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1144  GGDEF domain-containing protein  22.05 
 
 
754 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1933  sensory box protein  22.78 
 
 
692 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0364295  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4273  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.05 
 
 
754 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  20.9 
 
 
417 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1274  diguanylate cyclase  24.62 
 
 
353 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.32 
 
 
577 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1859  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.92 
 
 
917 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3547  diguanylate cyclase  19.05 
 
 
314 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  25.78 
 
 
718 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2332  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with FHA and GAF sensor  22.05 
 
 
884 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1808  hypothetical protein  24.17 
 
 
726 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0807  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.64 
 
 
803 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  22.9 
 
 
550 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3764  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.56 
 
 
577 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2580  GGDEF domain-containing protein  20.75 
 
 
1774 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05432  hypothetical protein  20.12 
 
 
915 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.56 
 
 
577 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1178  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.88 
 
 
754 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.578414 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3946  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.56 
 
 
577 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2937  signal transduction protein  19.18 
 
 
1141 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2151  diguanylate cyclase  24.18 
 
 
275 aa  46.2  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2067  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  20.55 
 
 
317 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2041  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  20.55 
 
 
317 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3370  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.48 
 
 
860 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.742202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0504  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.56 
 
 
577 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3194  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.95 
 
 
726 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.178802  normal  0.0329837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1055  sensory box protein  21.83 
 
 
462 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  20.55 
 
 
638 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.07 
 
 
1094 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1425  diguanylate cyclase  19.38 
 
 
424 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0545  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.13 
 
 
572 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0598  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  22.22 
 
 
622 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0884  diguanylate cyclase  21.66 
 
 
285 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.576242  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0606  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  22.22 
 
 
622 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2016  sensory box/GGDEF family protein  21.38 
 
 
799 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3124  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  19.69 
 
 
609 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2477  hypothetical protein  18.92 
 
 
273 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0397  diguanylate cyclase  22.44 
 
 
555 aa  45.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  20.63 
 
 
1125 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3485  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.13 
 
 
572 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.53 
 
 
574 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  22.22 
 
 
799 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.56 
 
 
572 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3125  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.88 
 
 
712 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3308  diguanylate cyclase  17.69 
 
 
603 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000660005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0466  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.22 
 
 
696 aa  45.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0862739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1333  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  20.55 
 
 
575 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>