108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2700 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2700  diguanylate cyclase  100 
 
 
218 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000527165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4015  hypothetical protein  62.91 
 
 
213 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3739  hypothetical protein  62.74 
 
 
213 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4120  hypothetical protein  62.44 
 
 
213 aa  279  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000136975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4102  hypothetical protein  60 
 
 
217 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.979257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1137  hypothetical protein  60.37 
 
 
217 aa  278  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00579887  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3755  hypothetical protein  61.79 
 
 
213 aa  277  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0428114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3826  putative diguanylate cyclase  60.83 
 
 
217 aa  276  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0556078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4048  hypothetical protein  61.32 
 
 
213 aa  275  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000128162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3907  hypothetical protein  61.5 
 
 
206 aa  270  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00587396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4213  hypothetical protein  61.5 
 
 
206 aa  270  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000232532  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1779  diguanylate cyclase  26.85 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  23.12 
 
 
781 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.015368  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3547  diguanylate cyclase  24.5 
 
 
314 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.928319  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0796  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.5 
 
 
765 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.341606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  20.67 
 
 
517 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0892  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.25 
 
 
693 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.914859  decreased coverage  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  21.82 
 
 
1125 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.84 
 
 
965 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.928447  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4948  sensory box protein  25.75 
 
 
921 aa  52  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  26.19 
 
 
1826 aa  51.6  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1184  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.35 
 
 
738 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3597  diguanylate cyclase  22.58 
 
 
385 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1227  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  20.95 
 
 
434 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1333  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.08 
 
 
575 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1034  diguanylate cyclase  22.37 
 
 
283 aa  48.9  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0846  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.24 
 
 
426 aa  48.9  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000113483  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3124  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.2 
 
 
609 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1170  hypothetical protein  23.36 
 
 
768 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1176  hypothetical protein  23.36 
 
 
768 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0773  diguanylate cyclase  25.81 
 
 
323 aa  47.8  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1078  diguanylate cyclase  21.57 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.239628  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1569  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  22.83 
 
 
643 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1635  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  22.83 
 
 
643 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.37 
 
 
869 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2850  diguanylate cyclase  28.7 
 
 
135 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000925897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3266  diguanylate cyclase  23.13 
 
 
355 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2576  diguanylate cyclase  25.13 
 
 
931 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000375627  hitchhiker  0.0011212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4280  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.15 
 
 
796 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.37 
 
 
869 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3531  diguanylate cyclase  20.17 
 
 
385 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25 
 
 
574 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3448  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.18 
 
 
696 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2656  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.18 
 
 
696 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0606  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  20.51 
 
 
622 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0598  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  20.51 
 
 
622 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1760  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.55 
 
 
473 aa  45.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.554911  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0590  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.29 
 
 
1144 aa  45.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.851066  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3333  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.93 
 
 
772 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.76 
 
 
1264 aa  45.1  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  22.22 
 
 
608 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  19.85 
 
 
356 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  24.73 
 
 
373 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.41 
 
 
577 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0571  putative GAF sensor protein  20.13 
 
 
622 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  21.21 
 
 
557 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3261  GGDEF domain-containing protein  20.69 
 
 
702 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.012427  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  26.47 
 
 
712 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  21.34 
 
 
799 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  20.41 
 
 
1079 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.17 
 
 
1094 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0406  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  21.43 
 
 
897 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1680  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  19.73 
 
 
1524 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.482461  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.24 
 
 
841 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4032  diguanylate cyclase  23.57 
 
 
561 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.211058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4265  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  21.78 
 
 
539 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4402  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.57 
 
 
563 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2332  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with FHA and GAF sensor  23.4 
 
 
884 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0463  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.38 
 
 
577 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3739  diguanylate cyclase  21.53 
 
 
407 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.864188  hitchhiker  0.0000559302 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1349  diguanylate cyclase  24.84 
 
 
179 aa  42.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1425  diguanylate cyclase  20.16 
 
 
424 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2367  diguanylate cyclase  24.32 
 
 
923 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.457753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1161  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.19 
 
 
754 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268415  normal  0.0126902 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.58 
 
 
800 aa  43.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0426061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  18.92 
 
 
585 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2449  GGDEF domain-containing protein  23.81 
 
 
498 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0043  diguanylate cyclase  20.86 
 
 
580 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1891  GGDEF family protein  28.87 
 
 
435 aa  42.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0989332  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1274  diguanylate cyclase  19.2 
 
 
353 aa  42.4  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  20.89 
 
 
550 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3853  diguanylate cyclase  23.58 
 
 
482 aa  42.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0518051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1445  putative diguanylate cyclase  19.08 
 
 
381 aa  42.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0717377  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.58 
 
 
668 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4552  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20.55 
 
 
624 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  21.92 
 
 
1099 aa  42.4  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  24.44 
 
 
434 aa  42  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  20.89 
 
 
600 aa  42.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0094  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  23.7 
 
 
721 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000375041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3089  sensory box protein  24.16 
 
 
858 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.168178  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0397  diguanylate cyclase  30.19 
 
 
555 aa  42  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2151  diguanylate cyclase  21 
 
 
275 aa  42  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0517711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0054  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  21.33 
 
 
467 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  22.78 
 
 
302 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  25.24 
 
 
836 aa  42  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3290  diguanylate cyclase  21.31 
 
 
473 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228847  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4985  sensory box protein  23.57 
 
 
1534 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0502  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.95 
 
 
705 aa  42  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4101  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.22 
 
 
794 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  19.39 
 
 
555 aa  41.6  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>