More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2807 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1255  methionine gamma-lyase  76.65 
 
 
433 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1317  methionine gamma-lyase  76.89 
 
 
433 aa  676    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.786115  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2511  methionine gamma-lyase  76.89 
 
 
433 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1327  methionine gamma-lyase  76.89 
 
 
433 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.403153  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2807  methionine gamma-lyase  100 
 
 
427 aa  880    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.684316  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1484  methionine gamma-lyase  76.42 
 
 
433 aa  685    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73007  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0992  methionine gamma-lyase  76.89 
 
 
433 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5613  methionine gamma-lyase  86.89 
 
 
427 aa  774    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.523956 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0300  methionine gamma-lyase  76.89 
 
 
433 aa  676    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.568745  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0575  methionine gamma-lyase  76.89 
 
 
433 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1017  methionine gamma-lyase  56.19 
 
 
427 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501384  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4740  methionine gamma-lyase  57.28 
 
 
427 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188705  normal  0.843485 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4673  methionine gamma-lyase  56.09 
 
 
427 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455912  normal  0.62719 
 
 
-
 
NC_004310  BR1965  methionine gamma-lyase  56.31 
 
 
427 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2201  methionine gamma-lyase  57.04 
 
 
427 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.149726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5459  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  57.61 
 
 
429 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3503  methionine gamma-lyase  57.38 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0251  cystathionine gamma-synthase  56.34 
 
 
429 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3235  cystathionine gamma-synthase  56.87 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661091  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1859  cystathionine gamma-synthase  52.24 
 
 
428 aa  425  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0621  Methionine gamma-lyase  49.52 
 
 
422 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0483  methionine gamma-lyase  48.39 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0856  methionine gamma-lyase  48.56 
 
 
439 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4038  cystathionine gamma-synthase  48.55 
 
 
424 aa  388  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.682768  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1177  Cystathionine gamma-synthase  49.17 
 
 
428 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0947319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3672  cystathionine gamma-lyase  46.97 
 
 
424 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1875  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  48 
 
 
375 aa  362  6e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2070  cystathionine gamma-synthase  45.26 
 
 
416 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  39.76 
 
 
398 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  40 
 
 
398 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  40 
 
 
398 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  40.1 
 
 
397 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  39.27 
 
 
400 aa  264  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  37.44 
 
 
399 aa  256  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  39.8 
 
 
397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  39.8 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  36.8 
 
 
392 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  39.29 
 
 
397 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  37.59 
 
 
396 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  39.13 
 
 
390 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  38.52 
 
 
397 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  36.36 
 
 
391 aa  246  4e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  35.89 
 
 
392 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  36.36 
 
 
392 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  39.03 
 
 
397 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  36.36 
 
 
392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  36.36 
 
 
392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  38.27 
 
 
397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  36.6 
 
 
391 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  36.6 
 
 
391 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  39.76 
 
 
396 aa  242  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.98 
 
 
406 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  36.55 
 
 
393 aa  242  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  36.12 
 
 
392 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  36.12 
 
 
392 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  36.12 
 
 
391 aa  242  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  37.56 
 
 
392 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  39.03 
 
 
397 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  35.66 
 
 
394 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  39.29 
 
 
397 aa  240  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  38.78 
 
 
397 aa  240  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.28 
 
 
397 aa  238  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  38.17 
 
 
390 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.62 
 
 
404 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  37.24 
 
 
400 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  37.75 
 
 
392 aa  237  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.62 
 
 
404 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.76 
 
 
408 aa  236  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  38.08 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  35.63 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  32.99 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  38.27 
 
 
392 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.27 
 
 
392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  37.19 
 
 
391 aa  233  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0729  methionine gamma-lyase  35.14 
 
 
386 aa  232  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1086  cystathionine gamma-synthase  35.75 
 
 
401 aa  231  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  33.57 
 
 
401 aa  231  2e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  38.07 
 
 
426 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.32 
 
 
393 aa  230  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0312  methionine gamma-lyase  35.53 
 
 
386 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  35.61 
 
 
418 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0316  methionine gamma-lyase  35.53 
 
 
386 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  36.73 
 
 
394 aa  229  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  37.15 
 
 
413 aa  229  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  35.53 
 
 
386 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  34.13 
 
 
397 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.22 
 
 
396 aa  227  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  36.13 
 
 
414 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  34.95 
 
 
390 aa  226  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24950  cystathionine gamma-synthase  39.17 
 
 
393 aa  226  7e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.55 
 
 
408 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.46 
 
 
406 aa  226  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.58 
 
 
389 aa  225  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  37.1 
 
 
394 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  37.53 
 
 
401 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  34.22 
 
 
394 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  34.01 
 
 
392 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1699  Methionine gamma-lyase  34.44 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  33.59 
 
 
388 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  35.99 
 
 
406 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>