More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2670 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 400 aa  817    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  51.15 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  50.65 
 
 		 392 aa  388  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  47.78 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  46.7 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  46.95 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  47.04 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  46.56 
 
 		 397 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  46.43 
 
 		 399 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  46.31 
 
 		 397 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  46.31 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  46.68 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  46.56 
 
 		 397 aa  358  9e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  48.34 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  45.92 
 
 		 391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  45.41 
 
 		 392 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  45.82 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  45.15 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  45.82 
 
 		 397 aa  353  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  44.9 
 
 		 392 aa  352  5e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  46.85 
 
 		 397 aa  352  5e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  47.03 
 
 		 378 aa  352  7e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  44.9 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  44.9 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  45.41 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  47.04 
 
 		 426 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  45.15 
 
 		 391 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  45.15 
 
 		 391 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  45.15 
 
 		 391 aa  348  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  46.11 
 
 		 378 aa  348  9e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  45.32 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  49.1 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  45.23 
 
 		 392 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  47.91 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  48.19 
 
 		 377 aa  346  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  46.48 
 
 		 390 aa  347  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  44.76 
 
 		 386 aa  346  5e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  47.38 
 
 		 377 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  46.43 
 
 		 426 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  46.79 
 
 		 426 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  46.43 
 
 		 413 aa  344  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  45.85 
 
 		 378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  45.32 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  46.92 
 
 		 381 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  47.27 
 
 		 392 aa  339  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  45.22 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  46.23 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  47.11 
 
 		 378 aa  337  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  44.7 
 
 		 390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  45.55 
 
 		 386 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  44.96 
 
 		 390 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  43.51 
 
 		 386 aa  335  5.999999999999999e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  45.38 
 
 		 386 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  45.22 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  45.65 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  44.19 
 
 		 398 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  46.13 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  46.53 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  44.56 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  45.11 
 
 		 407 aa  330  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  46.25 
 
 		 378 aa  330  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  44.39 
 
 		 379 aa  330  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  44.65 
 
 		 390 aa  330  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  45.95 
 
 		 378 aa  330  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  43.59 
 
 		 388 aa  329  6e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  43.49 
 
 		 379 aa  328  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  44.33 
 
 		 380 aa  328  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  45.19 
 
 		 393 aa  328  8e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  43.93 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  43.93 
 
 		 377 aa  328  9e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  43.58 
 
 		 398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  41.04 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  45.96 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  43.18 
 
 		 397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  42.6 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  43.32 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  43.67 
 
 		 377 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  47.4 
 
 		 378 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  44.07 
 
 		 418 aa  327  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  43.19 
 
 		 385 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  46.53 
 
 		 391 aa  326  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  43.67 
 
 		 377 aa  326  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  43.67 
 
 		 377 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  43.67 
 
 		 377 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  43.67 
 
 		 377 aa  326  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  42.89 
 
 		 377 aa  325  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  46.21 
 
 		 394 aa  325  6e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0945  cystathionine beta-lyase  47 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  46.92 
 
 		 397 aa  325  7e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  43.41 
 
 		 377 aa  325  9e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  45.57 
 
 		 383 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  45.55 
 
 		 381 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  43.08 
 
 		 379 aa  324  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  43.41 
 
 		 377 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  43.15 
 
 		 383 aa  323  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.82 
 
 		 396 aa  323  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  43.09 
 
 		 392 aa  322  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.24 
 
 		 406 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  44.91 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  44.22 
 
 		 380 aa  320  3e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>