More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2737 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  100 
 
 
391 aa  792    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  48.96 
 
 
392 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  48.09 
 
 
394 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  47.68 
 
 
390 aa  378  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  49.1 
 
 
393 aa  366  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  45.15 
 
 
399 aa  354  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6803  cystathionine gamma-synthase  47.78 
 
 
389 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  47.19 
 
 
397 aa  352  7e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4283  cystathionine gamma-synthase  47.52 
 
 
389 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0940043  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4838  cystathionine gamma-synthase  47.52 
 
 
389 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.370286 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  46.04 
 
 
401 aa  348  1e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  45.29 
 
 
394 aa  339  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  47.52 
 
 
397 aa  339  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  44.04 
 
 
392 aa  338  8e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  44.33 
 
 
393 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  47.52 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  44.87 
 
 
392 aa  334  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  47.26 
 
 
397 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  47.26 
 
 
397 aa  332  6e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  42.64 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.56 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  44.91 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  43.43 
 
 
385 aa  326  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  44.65 
 
 
397 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  44.5 
 
 
397 aa  325  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  45.01 
 
 
400 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  45.13 
 
 
393 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  44.39 
 
 
397 aa  323  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  44.99 
 
 
391 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  48.38 
 
 
377 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  47.41 
 
 
381 aa  320  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  40.55 
 
 
388 aa  320  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  45.57 
 
 
378 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  45.5 
 
 
398 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  44.25 
 
 
392 aa  319  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.06 
 
 
406 aa  319  6e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  46.02 
 
 
398 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.49 
 
 
396 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  45.71 
 
 
386 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.72 
 
 
389 aa  316  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  43.86 
 
 
397 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  39.74 
 
 
390 aa  316  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.84 
 
 
403 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.82 
 
 
392 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  44.16 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  45.5 
 
 
398 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  44.96 
 
 
377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.68 
 
 
403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  45.43 
 
 
392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  46.83 
 
 
408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.71 
 
 
395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  45.99 
 
 
390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  45.99 
 
 
390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  44.99 
 
 
394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  46.25 
 
 
390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  44.7 
 
 
383 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.01 
 
 
403 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  48.06 
 
 
397 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  44.82 
 
 
378 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  44.87 
 
 
396 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  45.52 
 
 
386 aa  311  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  42.39 
 
 
413 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  44.08 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.01 
 
 
403 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.64 
 
 
393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.01 
 
 
403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  45.62 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.98 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.98 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.86 
 
 
403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  46.53 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.75 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.36 
 
 
397 aa  306  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.49 
 
 
403 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  43.85 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.47 
 
 
393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  43.49 
 
 
390 aa  305  6e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  42.09 
 
 
392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  42.38 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  36.69 
 
 
391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  41.94 
 
 
392 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  42.75 
 
 
392 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.99 
 
 
402 aa  302  7.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  42.49 
 
 
391 aa  301  9e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  43.64 
 
 
378 aa  301  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  45.04 
 
 
388 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.26 
 
 
397 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  47.69 
 
 
401 aa  301  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  42.75 
 
 
391 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  42.75 
 
 
392 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  42.86 
 
 
379 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  42.75 
 
 
391 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  42.75 
 
 
392 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  41.07 
 
 
393 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  44.56 
 
 
380 aa  300  4e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  44.59 
 
 
399 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.16 
 
 
394 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.49 
 
 
387 aa  299  5e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2013  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.06 
 
 
428 aa  299  5e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  normal  0.048822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.2 
 
 
404 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>