More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0842 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 398 aa  823    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  46.58 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  45 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  48.22 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  46.56 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  48.5 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  45.98 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  44.78 
 
 		 401 aa  360  2e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  47.04 
 
 		 397 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  47.04 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  45.06 
 
 		 397 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  46.58 
 
 		 400 aa  356  5e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  46.79 
 
 		 397 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  46.53 
 
 		 397 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  46.79 
 
 		 397 aa  353  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  47.41 
 
 		 397 aa  345  8e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  44.25 
 
 		 399 aa  344  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  47.41 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  46.82 
 
 		 398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  46.37 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  47.12 
 
 		 401 aa  339  5e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  46.43 
 
 		 397 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  44.19 
 
 		 392 aa  338  9e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  46.63 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  46.63 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  45.66 
 
 		 392 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  45.69 
 
 		 392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  46.31 
 
 		 398 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  43.61 
 
 		 413 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  44.67 
 
 		 418 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  46.11 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  45.61 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  46.06 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  46 
 
 		 392 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  45.09 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  45.62 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  47.16 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  42.64 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  46.08 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  46.08 
 
 		 394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  42.36 
 
 		 392 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  42.11 
 
 		 392 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  42.36 
 
 		 391 aa  325  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  42.97 
 
 		 392 aa  325  9e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  42.11 
 
 		 392 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  42.11 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  42.11 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  41.84 
 
 		 385 aa  323  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  41.85 
 
 		 392 aa  322  5e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  42.36 
 
 		 391 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  42.36 
 
 		 391 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  44.5 
 
 		 393 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  44.08 
 
 		 391 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  43.39 
 
 		 400 aa  319  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  43.56 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  44.3 
 
 		 378 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0611  Cystathionine gamma-synthase  43.48 
 
 		 382 aa  316  5e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  42.49 
 
 		 390 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  46.09 
 
 		 378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  43.15 
 
 		 388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  42.24 
 
 		 390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.93 
 
 		 377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  42.24 
 
 		 390 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  42.61 
 
 		 400 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  43.59 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.68 
 
 		 393 aa  311  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.62 
 
 		 427 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.53 
 
 		 387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  43.12 
 
 		 377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  43.72 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  42.61 
 
 		 386 aa  309  5e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  45.24 
 
 		 390 aa  309  5e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.06 
 
 		 393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  43.41 
 
 		 377 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.31 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  39.29 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  40.21 
 
 		 386 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  45.66 
 
 		 390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  38.52 
 
 		 388 aa  305  8.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  40.97 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  43.96 
 
 		 380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.35 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  45.04 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0734  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  37.38 
 
 		 429 aa  303  3.0000000000000004e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.12755  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3857  cystathionine gamma-synthase  44.27 
 
 		 378 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0318176  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.92 
 
 		 389 aa  302  6.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  44.71 
 
 		 386 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  42.82 
 
 		 390 aa  302  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.22 
 
 		 394 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  39.64 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1264  trans-sulfuration enzyme family protein  46.13 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0391596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  41.01 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.11 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1995  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  42.82 
 
 		 403 aa  301  1e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  41.41 
 
 		 392 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2814  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  39.44 
 
 		 430 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.41 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.75 
 
 		 403 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  40.78 
 
 		 378 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  42.27 
 
 		 378 aa  299  5e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>